Protein–RNA interactions for Protein: Q99K70

Rragc, Ras-related GTP-binding protein C, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RragcQ99K70 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46.05■■■■■ 4.96
RragcQ99K70 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
RragcQ99K70 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
RragcQ99K70 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
RragcQ99K70 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
RragcQ99K70 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
RragcQ99K70 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
RragcQ99K70 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
RragcQ99K70 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
RragcQ99K70 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
RragcQ99K70 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
RragcQ99K70 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
RragcQ99K70 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
RragcQ99K70 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
RragcQ99K70 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RragcQ99K70 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
RragcQ99K70 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
RragcQ99K70 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RragcQ99K70 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
RragcQ99K70 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
RragcQ99K70 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
RragcQ99K70 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RragcQ99K70 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RragcQ99K70 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
RragcQ99K70 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RragcQ99K70 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RragcQ99K70 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
RragcQ99K70 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RragcQ99K70 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RragcQ99K70 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RragcQ99K70 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
RragcQ99K70 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
RragcQ99K70 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RragcQ99K70 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
RragcQ99K70 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
RragcQ99K70 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
RragcQ99K70 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
RragcQ99K70 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
RragcQ99K70 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RragcQ99K70 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
RragcQ99K70 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
RragcQ99K70 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
RragcQ99K70 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RragcQ99K70 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RragcQ99K70 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
RragcQ99K70 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RragcQ99K70 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
RragcQ99K70 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RragcQ99K70 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RragcQ99K70 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RragcQ99K70 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RragcQ99K70 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
RragcQ99K70 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
RragcQ99K70 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RragcQ99K70 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RragcQ99K70 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RragcQ99K70 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RragcQ99K70 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RragcQ99K70 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RragcQ99K70 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RragcQ99K70 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
RragcQ99K70 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RragcQ99K70 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RragcQ99K70 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RragcQ99K70 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RragcQ99K70 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RragcQ99K70 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RragcQ99K70 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RragcQ99K70 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
RragcQ99K70 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RragcQ99K70 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RragcQ99K70 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RragcQ99K70 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
RragcQ99K70 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RragcQ99K70 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RragcQ99K70 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RragcQ99K70 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RragcQ99K70 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
RragcQ99K70 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RragcQ99K70 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
RragcQ99K70 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RragcQ99K70 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RragcQ99K70 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RragcQ99K70 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RragcQ99K70 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RragcQ99K70 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RragcQ99K70 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
RragcQ99K70 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
RragcQ99K70 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RragcQ99K70 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RragcQ99K70 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RragcQ99K70 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RragcQ99K70 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RragcQ99K70 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RragcQ99K70 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
RragcQ99K70 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
RragcQ99K70 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RragcQ99K70 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RragcQ99K70 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RragcQ99K70 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms