Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.64■■■■■ 4.74
Otop3Q80UF9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Otop3Q80UF9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Otop3Q80UF9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Otop3Q80UF9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
Otop3Q80UF9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Otop3Q80UF9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
Otop3Q80UF9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
Otop3Q80UF9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
Otop3Q80UF9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Otop3Q80UF9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Otop3Q80UF9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Otop3Q80UF9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Otop3Q80UF9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Otop3Q80UF9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Otop3Q80UF9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Otop3Q80UF9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
Otop3Q80UF9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Otop3Q80UF9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Otop3Q80UF9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Otop3Q80UF9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Otop3Q80UF9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Otop3Q80UF9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Otop3Q80UF9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Otop3Q80UF9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Otop3Q80UF9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Otop3Q80UF9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Otop3Q80UF9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Otop3Q80UF9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Otop3Q80UF9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Otop3Q80UF9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Otop3Q80UF9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Otop3Q80UF9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Otop3Q80UF9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Otop3Q80UF9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Otop3Q80UF9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Otop3Q80UF9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Otop3Q80UF9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Otop3Q80UF9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Otop3Q80UF9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Otop3Q80UF9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Otop3Q80UF9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Otop3Q80UF9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Otop3Q80UF9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Otop3Q80UF9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Otop3Q80UF9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Otop3Q80UF9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Otop3Q80UF9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Otop3Q80UF9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Otop3Q80UF9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Otop3Q80UF9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Otop3Q80UF9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Otop3Q80UF9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Otop3Q80UF9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Otop3Q80UF9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Otop3Q80UF9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Otop3Q80UF9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Otop3Q80UF9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Otop3Q80UF9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Otop3Q80UF9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Otop3Q80UF9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Otop3Q80UF9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Otop3Q80UF9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Otop3Q80UF9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Otop3Q80UF9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Otop3Q80UF9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Otop3Q80UF9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Otop3Q80UF9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Otop3Q80UF9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Otop3Q80UF9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Otop3Q80UF9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Otop3Q80UF9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Otop3Q80UF9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Otop3Q80UF9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Otop3Q80UF9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Otop3Q80UF9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
Otop3Q80UF9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Otop3Q80UF9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Otop3Q80UF9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Otop3Q80UF9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Otop3Q80UF9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Otop3Q80UF9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Otop3Q80UF9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Otop3Q80UF9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Otop3Q80UF9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Otop3Q80UF9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Otop3Q80UF9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Otop3Q80UF9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Otop3Q80UF9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Otop3Q80UF9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Otop3Q80UF9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Otop3Q80UF9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Otop3Q80UF9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Otop3Q80UF9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Otop3Q80UF9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Otop3Q80UF9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Otop3Q80UF9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Otop3Q80UF9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Otop3Q80UF9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Otop3Q80UF9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms