Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Lhx6Q9R1R0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Lhx6Q9R1R0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Lhx6Q9R1R0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Lhx6Q9R1R0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lhx6Q9R1R0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Lhx6Q9R1R0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Lhx6Q9R1R0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Lhx6Q9R1R0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Lhx6Q9R1R0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Lhx6Q9R1R0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Lhx6Q9R1R0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Lhx6Q9R1R0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lhx6Q9R1R0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Lhx6Q9R1R0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Lhx6Q9R1R0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lhx6Q9R1R0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lhx6Q9R1R0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lhx6Q9R1R0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lhx6Q9R1R0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Lhx6Q9R1R0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lhx6Q9R1R0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lhx6Q9R1R0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lhx6Q9R1R0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lhx6Q9R1R0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lhx6Q9R1R0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lhx6Q9R1R0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lhx6Q9R1R0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lhx6Q9R1R0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Lhx6Q9R1R0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lhx6Q9R1R0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Lhx6Q9R1R0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Lhx6Q9R1R0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lhx6Q9R1R0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lhx6Q9R1R0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lhx6Q9R1R0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lhx6Q9R1R0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Lhx6Q9R1R0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lhx6Q9R1R0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lhx6Q9R1R0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lhx6Q9R1R0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lhx6Q9R1R0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Lhx6Q9R1R0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lhx6Q9R1R0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lhx6Q9R1R0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lhx6Q9R1R0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lhx6Q9R1R0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lhx6Q9R1R0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lhx6Q9R1R0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lhx6Q9R1R0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Lhx6Q9R1R0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lhx6Q9R1R0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lhx6Q9R1R0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lhx6Q9R1R0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lhx6Q9R1R0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Lhx6Q9R1R0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lhx6Q9R1R0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Lhx6Q9R1R0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lhx6Q9R1R0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lhx6Q9R1R0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Lhx6Q9R1R0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lhx6Q9R1R0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lhx6Q9R1R0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lhx6Q9R1R0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lhx6Q9R1R0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Lhx6Q9R1R0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lhx6Q9R1R0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lhx6Q9R1R0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lhx6Q9R1R0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lhx6Q9R1R0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lhx6Q9R1R0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lhx6Q9R1R0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lhx6Q9R1R0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Lhx6Q9R1R0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lhx6Q9R1R0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lhx6Q9R1R0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Lhx6Q9R1R0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Lhx6Q9R1R0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lhx6Q9R1R0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lhx6Q9R1R0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lhx6Q9R1R0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lhx6Q9R1R0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lhx6Q9R1R0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lhx6Q9R1R0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lhx6Q9R1R0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lhx6Q9R1R0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lhx6Q9R1R0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lhx6Q9R1R0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lhx6Q9R1R0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lhx6Q9R1R0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lhx6Q9R1R0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lhx6Q9R1R0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lhx6Q9R1R0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Lhx6Q9R1R0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lhx6Q9R1R0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lhx6Q9R1R0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lhx6Q9R1R0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lhx6Q9R1R0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lhx6Q9R1R0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lhx6Q9R1R0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms