Protein–RNA interactions for Protein: P54320

Eln, Elastin, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElnP54320 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
ElnP54320 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ElnP54320 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ElnP54320 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
ElnP54320 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
ElnP54320 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ElnP54320 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ElnP54320 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ElnP54320 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ElnP54320 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ElnP54320 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ElnP54320 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ElnP54320 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ElnP54320 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ElnP54320 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ElnP54320 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ElnP54320 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ElnP54320 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ElnP54320 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ElnP54320 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ElnP54320 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ElnP54320 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ElnP54320 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ElnP54320 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ElnP54320 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ElnP54320 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ElnP54320 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ElnP54320 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ElnP54320 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ElnP54320 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ElnP54320 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ElnP54320 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ElnP54320 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ElnP54320 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ElnP54320 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ElnP54320 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ElnP54320 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ElnP54320 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ElnP54320 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ElnP54320 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ElnP54320 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ElnP54320 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ElnP54320 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ElnP54320 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ElnP54320 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ElnP54320 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ElnP54320 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ElnP54320 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ElnP54320 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ElnP54320 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ElnP54320 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ElnP54320 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ElnP54320 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ElnP54320 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ElnP54320 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ElnP54320 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ElnP54320 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ElnP54320 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ElnP54320 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ElnP54320 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ElnP54320 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ElnP54320 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ElnP54320 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ElnP54320 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ElnP54320 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ElnP54320 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ElnP54320 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ElnP54320 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ElnP54320 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ElnP54320 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ElnP54320 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ElnP54320 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ElnP54320 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ElnP54320 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ElnP54320 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ElnP54320 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ElnP54320 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ElnP54320 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ElnP54320 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ElnP54320 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ElnP54320 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ElnP54320 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ElnP54320 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ElnP54320 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ElnP54320 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ElnP54320 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ElnP54320 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ElnP54320 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ElnP54320 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ElnP54320 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ElnP54320 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ElnP54320 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ElnP54320 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ElnP54320 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ElnP54320 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ElnP54320 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ElnP54320 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ElnP54320 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ElnP54320 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ElnP54320 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms