Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Hoxa2P31245 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Hoxa2P31245 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Hoxa2P31245 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Hoxa2P31245 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Hoxa2P31245 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Hoxa2P31245 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Hoxa2P31245 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Hoxa2P31245 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Hoxa2P31245 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Hoxa2P31245 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Hoxa2P31245 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Hoxa2P31245 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Hoxa2P31245 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Hoxa2P31245 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Hoxa2P31245 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Hoxa2P31245 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Hoxa2P31245 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Hoxa2P31245 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Hoxa2P31245 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Hoxa2P31245 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Hoxa2P31245 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Hoxa2P31245 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Hoxa2P31245 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Hoxa2P31245 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Hoxa2P31245 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Hoxa2P31245 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hoxa2P31245 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hoxa2P31245 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Hoxa2P31245 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Hoxa2P31245 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Hoxa2P31245 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hoxa2P31245 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Hoxa2P31245 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Hoxa2P31245 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hoxa2P31245 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Hoxa2P31245 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Hoxa2P31245 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hoxa2P31245 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hoxa2P31245 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hoxa2P31245 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hoxa2P31245 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hoxa2P31245 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hoxa2P31245 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hoxa2P31245 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hoxa2P31245 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hoxa2P31245 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hoxa2P31245 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hoxa2P31245 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Hoxa2P31245 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hoxa2P31245 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hoxa2P31245 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hoxa2P31245 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hoxa2P31245 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hoxa2P31245 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hoxa2P31245 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Hoxa2P31245 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hoxa2P31245 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hoxa2P31245 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hoxa2P31245 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Hoxa2P31245 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hoxa2P31245 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hoxa2P31245 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hoxa2P31245 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hoxa2P31245 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hoxa2P31245 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hoxa2P31245 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxa2P31245 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxa2P31245 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hoxa2P31245 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hoxa2P31245 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxa2P31245 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hoxa2P31245 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hoxa2P31245 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hoxa2P31245 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Hoxa2P31245 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hoxa2P31245 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxa2P31245 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hoxa2P31245 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hoxa2P31245 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hoxa2P31245 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hoxa2P31245 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hoxa2P31245 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hoxa2P31245 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hoxa2P31245 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hoxa2P31245 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hoxa2P31245 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Hoxa2P31245 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxa2P31245 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hoxa2P31245 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxa2P31245 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxa2P31245 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hoxa2P31245 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxa2P31245 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hoxa2P31245 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hoxa2P31245 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxa2P31245 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hoxa2P31245 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hoxa2P31245 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxa2P31245 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms