Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
Tulp1Q9Z273 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Tulp1Q9Z273 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Tulp1Q9Z273 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Tulp1Q9Z273 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Tulp1Q9Z273 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Tulp1Q9Z273 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Tulp1Q9Z273 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Tulp1Q9Z273 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Tulp1Q9Z273 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Tulp1Q9Z273 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Tulp1Q9Z273 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Tulp1Q9Z273 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Tulp1Q9Z273 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Tulp1Q9Z273 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Tulp1Q9Z273 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Tulp1Q9Z273 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Tulp1Q9Z273 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Tulp1Q9Z273 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Tulp1Q9Z273 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Tulp1Q9Z273 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Tulp1Q9Z273 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Tulp1Q9Z273 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Tulp1Q9Z273 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Tulp1Q9Z273 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Tulp1Q9Z273 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Tulp1Q9Z273 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Tulp1Q9Z273 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Tulp1Q9Z273 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Tulp1Q9Z273 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Tulp1Q9Z273 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Tulp1Q9Z273 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Tulp1Q9Z273 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Tulp1Q9Z273 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Tulp1Q9Z273 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Tulp1Q9Z273 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Tulp1Q9Z273 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Tulp1Q9Z273 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Tulp1Q9Z273 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Tulp1Q9Z273 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Tulp1Q9Z273 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Tulp1Q9Z273 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Tulp1Q9Z273 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Tulp1Q9Z273 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Tulp1Q9Z273 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Tulp1Q9Z273 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Tulp1Q9Z273 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Tulp1Q9Z273 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Tulp1Q9Z273 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Tulp1Q9Z273 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Tulp1Q9Z273 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Tulp1Q9Z273 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Tulp1Q9Z273 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Tulp1Q9Z273 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Tulp1Q9Z273 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Tulp1Q9Z273 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Tulp1Q9Z273 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Tulp1Q9Z273 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Tulp1Q9Z273 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Tulp1Q9Z273 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Tulp1Q9Z273 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Tulp1Q9Z273 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Tulp1Q9Z273 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Tulp1Q9Z273 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Tulp1Q9Z273 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Tulp1Q9Z273 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Tulp1Q9Z273 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Tulp1Q9Z273 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Tulp1Q9Z273 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Tulp1Q9Z273 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Tulp1Q9Z273 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Tulp1Q9Z273 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tulp1Q9Z273 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Tulp1Q9Z273 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Tulp1Q9Z273 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Tulp1Q9Z273 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Tulp1Q9Z273 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Tulp1Q9Z273 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Tulp1Q9Z273 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Tulp1Q9Z273 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Tulp1Q9Z273 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Tulp1Q9Z273 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Tulp1Q9Z273 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Tulp1Q9Z273 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Tulp1Q9Z273 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Tulp1Q9Z273 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Tulp1Q9Z273 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Tulp1Q9Z273 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Tulp1Q9Z273 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Tulp1Q9Z273 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Tulp1Q9Z273 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Tulp1Q9Z273 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Tulp1Q9Z273 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Tulp1Q9Z273 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Tulp1Q9Z273 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Tulp1Q9Z273 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Tulp1Q9Z273 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Tulp1Q9Z273 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Tulp1Q9Z273 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Tulp1Q9Z273 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.6 ms