Protein–RNA interactions for Protein: P30416

Fkbp4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fkbp4P30416 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC49.18■■■■■ 5.46
Fkbp4P30416 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
Fkbp4P30416 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
Fkbp4P30416 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
Fkbp4P30416 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42.61■■■■■ 4.41
Fkbp4P30416 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Fkbp4P30416 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
Fkbp4P30416 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Fkbp4P30416 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Fkbp4P30416 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Fkbp4P30416 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Fkbp4P30416 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.17
Fkbp4P30416 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
Fkbp4P30416 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Fkbp4P30416 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Fkbp4P30416 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Fkbp4P30416 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39.88■■■■□ 3.98
Fkbp4P30416 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Fkbp4P30416 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
Fkbp4P30416 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39.67■■■■□ 3.94
Fkbp4P30416 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Fkbp4P30416 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39.52■■■■□ 3.92
Fkbp4P30416 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Fkbp4P30416 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Fkbp4P30416 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
Fkbp4P30416 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Fkbp4P30416 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Fkbp4P30416 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Fkbp4P30416 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
Fkbp4P30416 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Fkbp4P30416 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39■■■■□ 3.83
Fkbp4P30416 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Fkbp4P30416 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Fkbp4P30416 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
Fkbp4P30416 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Fkbp4P30416 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Fkbp4P30416 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Fkbp4P30416 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Fkbp4P30416 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Fkbp4P30416 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Fkbp4P30416 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Fkbp4P30416 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Fkbp4P30416 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Fkbp4P30416 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Fkbp4P30416 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Fkbp4P30416 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Fkbp4P30416 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
Fkbp4P30416 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Fkbp4P30416 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Fkbp4P30416 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Fkbp4P30416 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Fkbp4P30416 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Fkbp4P30416 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Fkbp4P30416 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Fkbp4P30416 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Fkbp4P30416 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Fkbp4P30416 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
Fkbp4P30416 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Fkbp4P30416 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Fkbp4P30416 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Fkbp4P30416 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Fkbp4P30416 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Fkbp4P30416 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Fkbp4P30416 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Fkbp4P30416 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Fkbp4P30416 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Fkbp4P30416 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Fkbp4P30416 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Fkbp4P30416 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Fkbp4P30416 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Fkbp4P30416 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Fkbp4P30416 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Fkbp4P30416 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Fkbp4P30416 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Fkbp4P30416 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Fkbp4P30416 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Fkbp4P30416 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Fkbp4P30416 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Fkbp4P30416 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Fkbp4P30416 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Fkbp4P30416 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Fkbp4P30416 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Fkbp4P30416 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Fkbp4P30416 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Fkbp4P30416 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Fkbp4P30416 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Fkbp4P30416 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Fkbp4P30416 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Fkbp4P30416 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Fkbp4P30416 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Fkbp4P30416 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Fkbp4P30416 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Fkbp4P30416 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Fkbp4P30416 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Fkbp4P30416 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Fkbp4P30416 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Fkbp4P30416 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Fkbp4P30416 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Fkbp4P30416 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Fkbp4P30416 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms