RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000088652.5

Htatsf1-201, Transcript of HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Htatsf1, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Efcab5A0JP43 1406 aa23.3■■□□□ 1.32
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Ankrd26Q811D2 1581 aa23.3■■□□□ 1.32
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Aplp2Q06335 707 aa23.29■■□□□ 1.32
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Fam135aQ6NS59 1506 aa23.26■■□□□ 1.31
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Gm38655A0A286YDK6 273 aa23.24■■□□□ 1.31
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa23.23■■□□□ 1.31
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Naip1Q9QWK5 1403 aa23.23■■□□□ 1.31
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Kdm5bQ80Y84 1544 aa23.23■■□□□ 1.31
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Carmil1Q6EDY6 1374 aa23.21■■□□□ 1.31
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
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Htatsf1-201ENSMUST00000088652 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa23.19■■□□□ 1.3
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Pcf11G3X9Z4 1553 aa23.18■■□□□ 1.3
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Duox2A2AQ99 1517 aa23.14■■□□□ 1.3
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 CenpbP27790 599 aa23.13■■□□□ 1.29
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 BlmO88700 1416 aa23.12■■□□□ 1.29
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 CntlnA2AM05 1397 aa23.11■■□□□ 1.29
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Slx4Q6P1D7 1565 aa23.11■■□□□ 1.29
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Cux1P53564 1515 aa23.08■■□□□ 1.29
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Peg3Q3URU2 1571 aa23.08■■□□□ 1.29
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 SynmQ70IV5 1561 aa23.05■■□□□ 1.28
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Fyco1Q8VDC1 1437 aa23.02■■□□□ 1.28
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Rpap1Q80TE0 1409 aa22.98■■□□□ 1.27
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Samd9lQ69Z37 1561 aa22.98■■□□□ 1.27
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Myt1Q8CFC2 1127 aa22.9■■□□□ 1.26
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Htatsf1-201ENSMUST00000088652 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa22.86■■□□□ 1.25
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Crocc2F6XLV1 1638 aa22.85■■□□□ 1.25
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Aebp1Q640N1 1128 aa22.85■■□□□ 1.25
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Mia2Q91ZV0 1396 aa22.84■■□□□ 1.25
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Fhad1A6PWD2 1420 aa22.84■■□□□ 1.25
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa22.83■■□□□ 1.24
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Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Rad54l2Q99NG0 1466 aa22.81■■□□□ 1.24
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Ccer2J3QPU5 274 aa22.8■■□□□ 1.24
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Lmod2Q3UHZ5 550 aa22.79■■□□□ 1.24
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa22.78■■□□□ 1.24
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Vps8Q0P5W1 1427 aa22.77■■□□□ 1.24
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Kif21aQ9QXL2 1672 aa22.75■■□□□ 1.23
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa22.74■■□□□ 1.23
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Mrc2Q64449 1479 aa22.74■■□□□ 1.23
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Pla2r1Q62028 1487 aa22.73■■□□□ 1.23
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Naip2Q9QUK4 1447 aa22.71■■□□□ 1.23
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa22.71■■□□□ 1.23
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Abca5Q8K448 1642 aa22.71■■□□□ 1.23
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Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Magi3Q9EQJ9 1476 aa22.67■■□□□ 1.22
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 CadpsQ80TJ1 1355 aa22.66■■□□□ 1.22
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Fam71e1A1L3C1 212 aa22.65■■□□□ 1.22
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Gpatch8A2A6A1 1505 aa22.63■■□□□ 1.21
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Tnnt3Q9QZ47 272 aa22.62■■□□□ 1.21
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Grin2aP35436 1464 aa22.61■■□□□ 1.21
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 A2mQ6GQT1 1474 aa22.61■■□□□ 1.21
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Adamts12Q811B3 1600 aa22.59■■□□□ 1.21
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Ccnb3Q810T2 1396 aa22.58■■□□□ 1.2
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Gcc2Q8CHG3 1679 aa22.55■■□□□ 1.2
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Kif27Q7M6Z4 1394 aa22.55■■□□□ 1.2
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Disp1Q3TDN0 1521 aa22.54■■□□□ 1.2
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Plb1Q3TTY0 1478 aa22.54■■□□□ 1.2
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Soga1E1U8D0 1418 aa22.54■■□□□ 1.2
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Camsap2Q8C1B1 1461 aa22.53■■□□□ 1.2
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Fhod3Q76LL6 1578 aa22.53■■□□□ 1.2
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 WizO88286 1684 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
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Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Cul7Q8VE73 1689 aa22.49■■□□□ 1.19
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa22.48■■□□□ 1.19
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 NexmifQ5DTT1 1515 aa22.47■■□□□ 1.19
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Htatsf1-201ENSMUST00000088652 BC005561E9Q5E2 1589 aa22.44■■□□□ 1.18
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Znf710Q3U288 666 aa22.44■■□□□ 1.18
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Ift140E9PY46 1464 aa22.42■■□□□ 1.18
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Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Abca16E9PWJ7 1678 aa22.38■■□□□ 1.17
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Naip5Q9R016 1403 aa22.37■■□□□ 1.17
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Setd1bQ8CFT2 1985 aa22.37■■□□□ 1.17
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Ncoa2Q61026 1462 aa22.35■■□□□ 1.17
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Chic2Q9D9G3 165 aa22.33■■□□□ 1.17
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Setbp1Q9Z180 1582 aa22.33■■□□□ 1.17
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Mug1P28665 1476 aa22.32■■□□□ 1.16
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa22.32■■□□□ 1.16
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 WrnO09053 1401 aa22.31■■□□□ 1.16
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Ube2uB1AUC4 352 aa22.3■■□□□ 1.16
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Stra8P70278 393 aa22.27■■□□□ 1.16
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Ncoa3O09000 1398 aa22.26■■□□□ 1.15
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Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Plekhh2Q8C115 1491 aa22.26■■□□□ 1.15
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