RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026474.4

Gli1-201, Transcript of Zinc finger protein GLI1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gli1, Length 4,057 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ift140E9PY46 1464 aa21.7■■□□□ 1.06
Gli1-201ENSMUST00000026474 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
Gli1-201ENSMUST00000026474 Aebp1Q640N1 1128 aa21.65■■□□□ 1.06
Gli1-201ENSMUST00000026474 Samd9lQ69Z37 1561 aa21.63■■□□□ 1.05
Gli1-201ENSMUST00000026474 Mier1Q5UAK0 511 aa21.6■■□□□ 1.05
Gli1-201ENSMUST00000026474 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa21.59■■□□□ 1.05
Gli1-201ENSMUST00000026474 Map3k1P53349 1493 aa21.59■■□□□ 1.05
Gli1-201ENSMUST00000026474 SynmQ70IV5 1561 aa21.59■■□□□ 1.05
Gli1-201ENSMUST00000026474 Grin2aP35436 1464 aa21.57■■□□□ 1.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Disp1Q3TDN0 1521 aa21.56■■□□□ 1.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa21.55■■□□□ 1.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa21.54■■□□□ 1.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Fyco1Q8VDC1 1437 aa21.53■■□□□ 1.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Kif27Q7M6Z4 1394 aa21.53■■□□□ 1.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 WrnO09053 1401 aa21.48■■□□□ 1.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 CadpsQ80TJ1 1355 aa21.43■■□□□ 1.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa21.43■■□□□ 1.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Pla2r1Q62028 1487 aa21.41■■□□□ 1.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 CntlnA2AM05 1397 aa21.4■■□□□ 1.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa21.39■■□□□ 1.01
Gli1-201ENSMUST00000026474 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
Gli1-201ENSMUST00000026474 Fgd6Q69ZL1 1399 aa21.39■■□□□ 1.01
Gli1-201ENSMUST00000026474 Cux1P53564 1515 aa21.38■■□□□ 1.01
Gli1-201ENSMUST00000026474 Chic2Q9D9G3 165 aa21.37■■□□□ 1.01
Gli1-201ENSMUST00000026474 Magi3Q9EQJ9 1476 aa21.37■■□□□ 1.01
Gli1-201ENSMUST00000026474 Arap1Q4LDD4 1452 aa21.36■■□□□ 1.01
Gli1-201ENSMUST00000026474 Jph4Q80WT0 628 aa21.34■■□□□ 1.01
Gli1-201ENSMUST00000026474 Soga1E1U8D0 1418 aa21.33■■□□□ 1.01
Gli1-201ENSMUST00000026474 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa21.33■■□□□ 1
Gli1-201ENSMUST00000026474 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
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Gli1-201ENSMUST00000026474 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa21.3■■□□□ 1
Gli1-201ENSMUST00000026474 Arid3cA6PWV5 409 aa21.28■■□□□ 1
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Gli1-201ENSMUST00000026474 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
Gli1-201ENSMUST00000026474 WizO88286 1684 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
Gli1-201ENSMUST00000026474 Neo1P97798 1493 aa21.23■□□□□ 0.99
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ankrd26Q811D2 1581 aa21.22■□□□□ 0.99
Gli1-201ENSMUST00000026474 Rusc2Q80U22 1514 aa21.22■□□□□ 0.99
Gli1-201ENSMUST00000026474 Naip1Q9QWK5 1403 aa21.21■□□□□ 0.99
Gli1-201ENSMUST00000026474 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
Gli1-201ENSMUST00000026474 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa21.19■□□□□ 0.98
Gli1-201ENSMUST00000026474 Eid3Q3V124 375 aa21.18■□□□□ 0.98
Gli1-201ENSMUST00000026474 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa21.18■□□□□ 0.98
Gli1-201ENSMUST00000026474 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
Gli1-201ENSMUST00000026474 Pcf11G3X9Z4 1553 aa21.15■□□□□ 0.98
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm14025A2AP89 1413 aa21.15■□□□□ 0.98
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ccnb3Q810T2 1396 aa21.13■□□□□ 0.97
Gli1-201ENSMUST00000026474 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
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Gli1-201ENSMUST00000026474 Wdr66E9Q743 1299 aa21.1■□□□□ 0.97
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Gli1-201ENSMUST00000026474 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa21.06■□□□□ 0.96
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tiam1Q60610 1591 aa21.06■□□□□ 0.96
Gli1-201ENSMUST00000026474 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ncoa2Q61026 1462 aa21.03■□□□□ 0.96
Gli1-201ENSMUST00000026474 Shroom2A2ALU4 1481 aa21.03■□□□□ 0.96
Gli1-201ENSMUST00000026474 Mtus2Q3UHD3 1353 aa21.02■□□□□ 0.96
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa21■□□□□ 0.95
Gli1-201ENSMUST00000026474 Adamts12Q811B3 1600 aa21■□□□□ 0.95
Gli1-201ENSMUST00000026474 Cabp1Q9JLK7 227 aa20.99■□□□□ 0.95
Gli1-201ENSMUST00000026474 Neurod1Q60867 357 aa20.98■□□□□ 0.95
Gli1-201ENSMUST00000026474 Slx4Q6P1D7 1565 aa20.95■□□□□ 0.95
Gli1-201ENSMUST00000026474 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
Gli1-201ENSMUST00000026474 TonslQ6NZL6 1363 aa20.94■□□□□ 0.94
Gli1-201ENSMUST00000026474 Abcc1O35379 1528 aa20.93■□□□□ 0.94
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tdrd9Q14BI7 1383 aa20.93■□□□□ 0.94
Gli1-201ENSMUST00000026474 Abca16E9PWJ7 1678 aa20.92■□□□□ 0.94
Gli1-201ENSMUST00000026474 Mug1P28665 1476 aa20.91■□□□□ 0.94
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Gli1-201ENSMUST00000026474 Abca5Q8K448 1642 aa20.89■□□□□ 0.93
Gli1-201ENSMUST00000026474 Fam163aQ8CAA5 168 aa20.88■□□□□ 0.93
Gli1-201ENSMUST00000026474 Setd1bQ8CFT2 1985 aa20.87■□□□□ 0.93
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Gli1-201ENSMUST00000026474 Magi1Q6RHR9 1471 aa20.86■□□□□ 0.93
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Gli1-201ENSMUST00000026474 Mia2Q91ZV0 1396 aa20.84■□□□□ 0.93
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Gli1-201ENSMUST00000026474 Erich6D3Z6S9 713 aa20.82■□□□□ 0.92
Gli1-201ENSMUST00000026474 Lemd3Q9WU40 921 aa20.81■□□□□ 0.92
Gli1-201ENSMUST00000026474 BC005561E9Q5E2 1589 aa20.81■□□□□ 0.92
Gli1-201ENSMUST00000026474 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
Gli1-201ENSMUST00000026474 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa20.79■□□□□ 0.92
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Gli1-201ENSMUST00000026474 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa20.72■□□□□ 0.91
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