RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516032.1

RNU6-1334P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1334, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1334P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1334P-201ENST00000516032 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SPATA45Q537H7 98 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 BPESC1Q9GZL8 116 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MYO3AQ8NEV4 1616 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SDK2Q58EX2 2172 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SDHAF1A6NFY7 115 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GAS8-AS1O95177 125 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 Q5VV11 94 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 VMO1Q7Z5L0 202 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PRO0461Q9UI25 63 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PTPRDP23468 1912 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 A0A0J9YY99 117 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 A8MU10 97 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 COX6CP09669 75 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 FREM3P0C091 2139 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 FAM223AQ8IWN6 122 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 IQGAP3Q86VI3 1631 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LTN1O94822 1766 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 F2Z2F3 143 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 EFNA4P52798 201 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SMIM11AP58511 58 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 HEPN1Q6WQI6 88 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MICAL3Q7RTP6 2002 aa3.34□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NCOA2Q15596 1464 aa3.34□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ABCA8O94911 1581 aa3.34□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MROH1Q8NDA8 1641 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MYH4Q9Y623 1939 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 H3BRN7 92 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 IGLV3-1P01715 115 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LINC00315P59091 139 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KLKP1Q107X0 134 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 HMGN3Q15651 99 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ZNF56Q15929 161 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 C10orf55Q5SWW7 151 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PRR9Q5T870 116 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 C20orf197Q8N268 126 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DYNLRB1Q9NP97 96 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KLK9Q9UKQ9 250 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CFAP74Q9C0B2 1584 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LTBP2Q14767 1821 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DOCK2Q92608 1830 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CLPSL1A2RUU4 121 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 C18orf32Q8TCD1 76 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 WFDC10AQ9H1F0 79 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NRXN1Q9ULB1 1477 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SEC16AO15027 2179 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DNAL4O96015 105 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 IGHV3-30P01768 117 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PCNX2A6NKB5 2137 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 UBR1Q8IWV7 1749 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MYO5CQ9NQX4 1742 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 IQSEC2Q5JU85 1478 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 HFM1A2PYH4 1435 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 HIGD1CA8MV81 97 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 BCE1O60756 84 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PDE6GP18545 87 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 COL4A2P08572 1712 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 COL4A6Q14031 1691 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PTPN23Q9H3S7 1636 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TMEM14DPA8MWL7 114 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 HMGN4O00479 90 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PPP1R17O96001 155 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ACYP1P07311 99 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KRTAP10-11P60412 298 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CFAP126Q5VTH2 177 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LINC00643Q86TS7 51 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LENEPQ9Y5L5 61 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1334P-201ENST00000516032 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.2 ms