RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 PLAUP00749 431 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 EBI3Q14213 229 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF503Q96F45 646 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 EMC6Q9BV81 110 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 NDUFC2O95298 119 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 WT1P19544 449 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 ARFRP1Q13795 201 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC01590Q5TEZ4 76 aa5.38□□□□□ -1.55
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RABGEF1-202ENST00000380828 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
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RABGEF1-202ENST00000380828 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa5.38□□□□□ -1.55
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RABGEF1-202ENST00000380828 COX6A1P12074 109 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 GDF5OSQ5U4N7 250 aa5.38□□□□□ -1.55
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RABGEF1-202ENST00000380828 LY6G5BQ8NDX9 201 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF442Q9H7R0 627 aa5.38□□□□□ -1.55
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RABGEF1-202ENST00000380828 C12orf74Q32Q52 190 aa5.37□□□□□ -1.55
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RABGEF1-202ENST00000380828 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
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RABGEF1-202ENST00000380828 HLA-DOBP13765 273 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR38Q5JTN6 314 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 C20orf204Q6ZNR8 217 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 CD177Q8N6Q3 437 aa5.37□□□□□ -1.55
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RABGEF1-202ENST00000380828 C8orf87E5RJ46 101 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 CDAP32320 146 aa5.37□□□□□ -1.55
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RABGEF1-202ENST00000380828 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 SPANXCQ9NY87 97 aa5.37□□□□□ -1.55
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RABGEF1-202ENST00000380828 MED12Q93074 2177 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A096LPE4 126 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1W2PPZ6 126 aa5.36□□□□□ -1.55
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RABGEF1-202ENST00000380828 ATP5G1P05496 136 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 LYZL2Q7Z4W2 148 aa5.36□□□□□ -1.55
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RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM52Q8NDY8 209 aa5.36□□□□□ -1.55
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RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM155Q4W5P6 130 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 ABCA1O95477 2261 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa5.36□□□□□ -1.55
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RABGEF1-202ENST00000380828 SCRG1O75711 98 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF56Q15929 161 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 C22orf39Q6P5X5 142 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF182Q8N6D2 247 aa5.36□□□□□ -1.55
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RABGEF1-202ENST00000380828 A0A0A6YYD4 124 aa5.35□□□□□ -1.55
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RABGEF1-202ENST00000380828 CST7O76096 145 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 PRR14LQ5THK1 2151 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 LEPROTL1O95214 131 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 LTAP01374 205 aa5.35□□□□□ -1.55
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RABGEF1-202ENST00000380828 SPATA3Q8NHX4 192 aa5.35□□□□□ -1.55
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RABGEF1-202ENST00000380828 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
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RABGEF1-202ENST00000380828 PYYP10082 97 aa5.35□□□□□ -1.55
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RABGEF1-202ENST00000380828 SPACA3Q8IXA5 215 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 C1orf158Q8N1D5 194 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 OR5C1Q8NGR4 320 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 RTL8AQ9BWD3 113 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 WDFY4Q6ZS81 3184 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa5.34□□□□□ -1.55
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