RNA–Protein interactions for RNA: YPL179W

PPQ1, Transcript of Protein phosphatase that regulates the mating response, yeast

Gene PPQ1, Length 1,650 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PPQ1	YPL179W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	TAD1	P53065	400 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	VID30	P53076	958 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	CUL3	P53202	744 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	MRPL22	P53881	309 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	TIM8	P57744	87 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	MUK1	Q02866	612 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	SPO20	Q04359	397 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	APL4	Q12028	832 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	SLX4	Q12098	748 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	INO1	P11986	533 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	IME1	P21190	360 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.75	not detected
PPQ1	YPL179W	DPH2	P32461	534 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	SGM1	P47166	707 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	SNO2	P53823	222 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	VPS75	P53853	264 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	ECM30	Q06673	1274 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	SHS1	Q07657	551 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	ACM1	Q08981	209 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	WHI2	P12611	486 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	BAS1	P22035	811 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	RNQ1	P25367	405 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	XRS2	P33301	854 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	SLA2	P33338	968 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	DRE2	P36152	348 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	VFA1	P40080	203 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	YFL054C	P43549	646 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	UME1	Q03010	460 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	DON1	Q05610	365 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	COG4	Q06096	861 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	ECM7	Q06200	448 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	OSW2	Q12202	724 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	HIF1	Q12373	385 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	SPO12	P17123	173 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	GLN3	P18494	730 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	AGP1	P25376	633 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	APL1	P27351	700 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
PPQ1	YPL179W	YKL107W	P34251	309 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	SAP190	P36123	1033 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	PCH2	P38126	564 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	EFM2	P38347	419 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	NPP2	P39997	493 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	IES1	P43579	692 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	ZAP1	P47043	880 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	HMI1	Q12039	706 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	HIP1	P06775	603 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	CDC42	P19073	191 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	PRR1	P28708	518 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	THI80	P35202	319 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	OSW7	P43611	510 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	YGL176C	P46945	554 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	RIM8	P53179	542 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	HFI1	Q12060	488 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	ATG9	Q12142	997 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	SOD2	P00447	233 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	CBF2	P32504	956 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	MRX3	P38172	270 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	MMS4	P38257	691 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	YER186C	P40101	306 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.12	□□□□□ -1.75	not detected
PPQ1	YPL179W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	CPR7	P47103	393 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	GCV2	P49095	1034 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	RSM24	Q03976	319 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	PPM1	Q04081	328 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	SHE9	Q04172	456 aa		4.12	□□□□□ -1.75

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