RNA–Protein interactions for RNA: YOL087C

DUF1, Transcript of Ubiquitin-binding protein of unknown function, yeast

Gene DUF1, Length 3,351 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DUF1	YOL087C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.15	□□□□□ -1.9	not detected
DUF1	YOL087C	SMI1	P32566	505 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DUF1	YOL087C	SLC1	P33333	303 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DUF1	YOL087C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
DUF1	YOL087C	RFC3	P38629	340 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DUF1	YOL087C	MRX1	P40050	688 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DUF1	YOL087C	LCB2	P40970	561 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DUF1	YOL087C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
DUF1	YOL087C	ALG2	P43636	503 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DUF1	YOL087C	VPS4	P52917	437 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DUF1	YOL087C	YNL050C	P53952	270 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DUF1	YOL087C	OAZ1	Q02803	292 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DUF1	YOL087C	UFO1	Q04511	668 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DUF1	YOL087C	YCG1	Q06680	1035 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DUF1	YOL087C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
DUF1	YOL087C	YOR223W	Q12015	292 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DUF1	YOL087C	AI3	P03877	415 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	CWH43	P25618	953 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	NGG1	P32494	702 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	YBR284W	P38150	797 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	PXA1	P41909	870 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	MDR1	P53258	950 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	NSG2	P53898	299 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	HFI1	Q12060	488 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	YRM1	Q12340	786 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	ISA2	Q12425	185 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	MGM1	P32266	881 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	SPC110	P32380	944 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	GPB2	P39717	880 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	YGL176C	P46945	554 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	ASK10	P48361	1146 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	RKM2	Q03942	479 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	RSF1	Q05043	376 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	ENA1	P13587	1091 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	SPS22	P25380	463 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	DMC1	P25453	334 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	HMX1	P32339	317 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	YEL043W	P32618	956 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	HSL7	P38274	827 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	PUG1	P40100	303 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	YIR014W	P40570	242 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	MMM1	P41800	426 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	YFL052W	P43551	465 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	SIP4	P46954	829 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	CTF18	P49956	741 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	TAD1	P53065	400 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	CBK1	P53894	756 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	ENA2	Q01896	1091 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	MRPL13	Q02204	264 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	KCS1	Q12494	1050 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	PTC5	Q12511	572 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	ENA5	Q12691	1091 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	ISN1	Q99312	450 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	HMG1	P12683	1054 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	ATP12	P22135	325 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	DOM34	P33309	386 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	GCS1	P35197	352 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	IFA38	P38286	347 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	MTG2	P38860	518 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	STN1	P38960	494 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	SPO22	P40511	975 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	THI6	P41835	540 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	DON1	Q05610	365 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	MDY2	Q12285	212 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	TAF3	Q12297	353 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	GLE1	Q12315	538 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	GRX6	Q12438	231 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	YLR358C	O13565	187 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.14	□□□□□ -1.91	not detected
DUF1	YOL087C	ADP1	P25371	1049 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	HOG1	P32485	435 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	MRP4	P32902	394 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	LOT5	P34234	306 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	YUH1	P35127	236 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	MMS4	P38257	691 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91

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