RNA–Protein interactions for RNA: YOL021C

DIS3, Transcript of Exosome core complex catalytic subunit, yeast

Gene DIS3, Length 3,006 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DIS3	YOL021C	FHN1	P53279	174 aa		2.62	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	MHP1	P43638	1398 aa		2.61	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	TSR4	P25040	408 aa		2.61	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	KCC4	P25389	1037 aa		2.61	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	PAF1	P38351	445 aa		2.61	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	YHR033W	P38690	423 aa		2.61	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	PPN1	Q04119	674 aa		2.61	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		2.61	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	CTT1	P06115	562 aa		2.61	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	PRP28	P23394	588 aa		2.61	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	NTH1	P32356	751 aa		2.61	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	GID8	P40208	455 aa		2.61	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	ECM9	Q02202	377 aa		2.61	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	YPS7	Q06325	596 aa		2.61	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	SWI6	P09959	803 aa		2.6	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	STE12	P13574	688 aa		2.6	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	DGR2	P32330	852 aa		2.6	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	DID4	P36108	232 aa		2.6	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	SET3	P36124	751 aa		2.6	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	BIT61	P47041	543 aa		2.6	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	YFT2	Q06676	274 aa		2.6	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	RIM15	P43565	1770 aa		2.6	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	APL3	P38065	1025 aa		2.6	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	TMN3	P40071	706 aa		2.6	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	TAH11	P47112	604 aa		2.6	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	DAL3	P32459	195 aa		2.6	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	GMH1	P36125	273 aa		2.6	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	BDH2	P39713	417 aa		2.6	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	YIL166C	P40445	542 aa		2.6	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	VID28	P40547	921 aa		2.6	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	SPO1	P53541	631 aa		2.6	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	ELF1	P36053	145 aa		2.59	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	EAF6	P47128	113 aa		2.59	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	TAF4	P50105	388 aa		2.59	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	YPR027C	Q12079	277 aa		2.59	□□□□□ -1.99
DIS3	YOL021C	PPE1	P38796	400 aa		2.59	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	GPG1	P53130	126 aa		2.59	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	IOC4	Q04213	475 aa		2.59	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.59	□□□□□ -2	not detected
DIS3	YOL021C	RMP1	Q12530	201 aa		2.59	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	OAF3	P36023	863 aa		2.58	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	CTP1	P38152	299 aa		2.58	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	FAT1	P38225	669 aa		2.58	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	DIP5	P53388	608 aa		2.58	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	AIM41	Q12032	185 aa		2.58	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	SUT2	Q12286	268 aa		2.58	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	LAM4	P38800	1345 aa		2.58	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	HXT7	P39004	570 aa		2.58	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	BUD8	P41698	603 aa		2.58	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	PMT6	P42934	759 aa		2.58	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	MFM1	Q02783	413 aa		2.58	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	TRS23	Q03784	219 aa		2.58	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	STP4	Q07351	490 aa		2.58	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	ESL2	P36168	1195 aa		2.58	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	UBP12	P39538	1254 aa		2.58	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	SPC105	P53148	917 aa		2.58	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	TRE2	Q08693	809 aa		2.58	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	RKI1	Q12189	258 aa		2.58	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	KHA1	P40309	873 aa		2.57	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	ATF1	P40353	525 aa		2.57	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	YGL081W	P53156	320 aa		2.57	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	MDR1	P53258	950 aa		2.57	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	DOS2	P54858	310 aa		2.57	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	HFI1	Q12060	488 aa		2.57	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	TIM50	Q02776	476 aa		2.57	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	FMP30	Q02883	468 aa		2.57	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	YML122C	Q03207	126 aa		2.57	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	FIG2	P25653	1609 aa		2.56	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	TUP1	P16649	713 aa		2.56	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	RIM4	P38741	713 aa		2.56	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	THI6	P41835	540 aa		2.56	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
DIS3	YOL021C	UFO1	Q04511	668 aa		2.56	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.3 ms