RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025262.5

Ltb-201, Transcript of Lymphotoxin-beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ltb, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cyp2c50Q91X77 490 aa23.77■■□□□ 1.4
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kiaa0100Q5SYL3 2234 aa23.77■■□□□ 1.4
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pagr1bF6V0H0 108 aa23.76■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gja8P28236 440 aa23.76■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 PrkczQ02956 592 aa23.76■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kif22Q3V300 660 aa23.76■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 Map10Q8BJS7 891 aa23.76■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 Q8C5K5 320 aa23.76■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pagr1aQ99L02 253 aa23.76■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fbxo3Q9DC63 480 aa23.76■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 Arfgef1G3X9K3 1846 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mum1Q6DID5 682 aa23.75■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sptlc3Q8BG54 563 aa23.75■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 Plekhg2Q6KAU7 1340 aa23.75■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fdx1P46656 188 aa23.74■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 AsnsQ61024 561 aa23.74■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 Aoc2Q812C9 757 aa23.74■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 Phf20l1Q8CCJ9 1013 aa23.74■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 Anks4bQ8K3X6 423 aa23.74■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 Itm2cQ91VK4 269 aa23.74■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 Atp2b3Q0VF55 1220 aa23.73■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 YdjcQ14BV6 310 aa23.73■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 Arl14Q3SXC5 192 aa23.73■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ppp1r21Q3TDD9 780 aa23.73■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tbc1d2bQ3U0J8 965 aa23.73■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 Atxn7Q8R4I1 867 aa23.73■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 CsadQ9DBE0 493 aa23.73■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 RabggtaQ9JHK4 567 aa23.73■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc7a3P70423 618 aa23.72■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 Aox4Q3TYQ9 1336 aa23.71■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ankrd44B2RXR6 993 aa23.71■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sept1P42209 366 aa23.71■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kiaa0753Q6A000 959 aa23.71■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 U2af1l4Q8BGJ9 220 aa23.71■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ciao1Q99KN2 339 aa23.71■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 Elp3Q9CZX0 547 aa23.71■■□□□ 1.39
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa23.7■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm44503E9PYU5 387 aa23.7■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dnaaf4Q8R368 420 aa23.7■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ccne2Q9Z238 404 aa23.7■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kmt2eQ3UG20 1868 aa23.69■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Adam7O35227 789 aa23.69■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nck2O55033 380 aa23.69■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 SqleP52019 572 aa23.69■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lamc2Q61092 1191 aa23.69■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pram1Q6BCL1 675 aa23.69■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Snx17Q8BVL3 470 aa23.69■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Izumo3A6PWV3 263 aa23.68■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Trap1aP19473 224 aa23.68■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Garem2Q6PAJ3 880 aa23.68■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Hps4Q99KG7 671 aa23.68■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fam84aQ9D650 292 aa23.68■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Grem2O88273 168 aa23.67■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 NefhP19246 1090 aa23.67■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 SelpQ01102 768 aa23.67■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Stxbp2Q64324 593 aa23.67■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc45a1Q8BIV7 751 aa23.67■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ptcd2Q8R3K3 381 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Katnbl1Q9CWJ3 299 aa23.67■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 DcpsQ9DAR7 338 aa23.67■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rgs12Q8CGE9 1381 aa23.66■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ms4a4aA0A087WRT7 236 aa23.66■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Btg4O70552 250 aa23.66■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tbc1d9bQ5SVR0 1263 aa23.66■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Smoc2Q8CD91 447 aa23.66■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zswim3Q8CFL8 695 aa23.66■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Capn10Q9ESK3 666 aa23.66■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 PtpraP18052 829 aa23.65■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Csf2raQ00941 388 aa23.65■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Q3UPC7 1272 aa23.65■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Srrm1Q52KI8 946 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Crhr2Q60748 411 aa23.65■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cracr2bQ80ZJ8 394 aa23.65■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mei1Q9D4I2 1268 aa23.65■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kntc1Q8C3Y4 2207 aa23.65■■□□□ 1.38
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pus7B7ZNL8 666 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tnni2P13412 182 aa23.64■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Btbd1P58544 488 aa23.64■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zfp953Q3UPV7 304 aa23.64■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rgl2Q61193 778 aa23.64■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Spata7Q80VP2 582 aa23.64■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dis3l2Q8CI75 870 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Yipf1Q91VU1 306 aa23.64■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Myh13B1AR69 1938 aa23.63■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 FlgP11088 336 aa23.63■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Col19a1Q0VF58 1136 aa23.63■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 PomkQ3TUA9 349 aa23.63■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc16a10Q3U9N9 512 aa23.63■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ptpn18Q61152 453 aa23.63■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Taf5lQ91WQ5 589 aa23.63■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sept14Q9DA97 430 aa23.63■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Znhit2Q9QY66 399 aa23.63■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 1700003F12RikA2AKE5 210 aa23.62■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 SfswapQ3USH5 945 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tmem87bQ8BKU8 555 aa23.62■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Snapc2Q91XA5 359 aa23.62■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nf2P46662 596 aa23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48.7 ms