Protein–RNA interactions for Protein: O88273

Grem2, Gremlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grem2O88273 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46.02■■■■■ 4.96
Grem2O88273 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Grem2O88273 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Grem2O88273 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
Grem2O88273 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
Grem2O88273 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Grem2O88273 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
Grem2O88273 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Grem2O88273 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Grem2O88273 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Grem2O88273 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Grem2O88273 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
Grem2O88273 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Grem2O88273 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Grem2O88273 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Grem2O88273 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
Grem2O88273 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Grem2O88273 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
Grem2O88273 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Grem2O88273 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Grem2O88273 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Grem2O88273 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Grem2O88273 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Grem2O88273 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Grem2O88273 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Grem2O88273 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Grem2O88273 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Grem2O88273 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Grem2O88273 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Grem2O88273 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Grem2O88273 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Grem2O88273 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Grem2O88273 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Grem2O88273 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Grem2O88273 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Grem2O88273 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Grem2O88273 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Grem2O88273 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Grem2O88273 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Grem2O88273 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Grem2O88273 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Grem2O88273 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Grem2O88273 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Grem2O88273 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Grem2O88273 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Grem2O88273 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Grem2O88273 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Grem2O88273 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Grem2O88273 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Grem2O88273 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Grem2O88273 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Grem2O88273 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Grem2O88273 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Grem2O88273 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Grem2O88273 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Grem2O88273 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Grem2O88273 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Grem2O88273 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Grem2O88273 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Grem2O88273 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Grem2O88273 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Grem2O88273 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Grem2O88273 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Grem2O88273 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Grem2O88273 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Grem2O88273 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Grem2O88273 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Grem2O88273 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Grem2O88273 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Grem2O88273 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Grem2O88273 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Grem2O88273 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Grem2O88273 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Grem2O88273 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Grem2O88273 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Grem2O88273 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Grem2O88273 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Grem2O88273 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Grem2O88273 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Grem2O88273 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Grem2O88273 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Grem2O88273 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Grem2O88273 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Grem2O88273 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Grem2O88273 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Grem2O88273 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Grem2O88273 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Grem2O88273 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Grem2O88273 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Grem2O88273 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Grem2O88273 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Grem2O88273 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Grem2O88273 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Grem2O88273 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Grem2O88273 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Grem2O88273 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Grem2O88273 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Grem2O88273 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Grem2O88273 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Grem2O88273 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms