Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46■■■■■ 4.95
RabggtaQ9JHK4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
RabggtaQ9JHK4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
RabggtaQ9JHK4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40.05■■■■■ 4
RabggtaQ9JHK4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
RabggtaQ9JHK4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
RabggtaQ9JHK4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
RabggtaQ9JHK4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
RabggtaQ9JHK4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
RabggtaQ9JHK4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
RabggtaQ9JHK4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
RabggtaQ9JHK4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
RabggtaQ9JHK4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
RabggtaQ9JHK4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
RabggtaQ9JHK4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
RabggtaQ9JHK4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
RabggtaQ9JHK4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
RabggtaQ9JHK4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
RabggtaQ9JHK4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
RabggtaQ9JHK4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
RabggtaQ9JHK4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
RabggtaQ9JHK4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
RabggtaQ9JHK4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RabggtaQ9JHK4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RabggtaQ9JHK4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
RabggtaQ9JHK4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RabggtaQ9JHK4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RabggtaQ9JHK4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RabggtaQ9JHK4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
RabggtaQ9JHK4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
RabggtaQ9JHK4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RabggtaQ9JHK4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
RabggtaQ9JHK4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RabggtaQ9JHK4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
RabggtaQ9JHK4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RabggtaQ9JHK4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
RabggtaQ9JHK4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RabggtaQ9JHK4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
RabggtaQ9JHK4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
RabggtaQ9JHK4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RabggtaQ9JHK4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
RabggtaQ9JHK4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RabggtaQ9JHK4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
RabggtaQ9JHK4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
RabggtaQ9JHK4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
RabggtaQ9JHK4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
RabggtaQ9JHK4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RabggtaQ9JHK4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RabggtaQ9JHK4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RabggtaQ9JHK4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
RabggtaQ9JHK4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
RabggtaQ9JHK4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
RabggtaQ9JHK4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RabggtaQ9JHK4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RabggtaQ9JHK4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RabggtaQ9JHK4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
RabggtaQ9JHK4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RabggtaQ9JHK4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RabggtaQ9JHK4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RabggtaQ9JHK4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
RabggtaQ9JHK4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RabggtaQ9JHK4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
RabggtaQ9JHK4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RabggtaQ9JHK4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RabggtaQ9JHK4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
RabggtaQ9JHK4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RabggtaQ9JHK4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RabggtaQ9JHK4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RabggtaQ9JHK4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RabggtaQ9JHK4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RabggtaQ9JHK4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RabggtaQ9JHK4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RabggtaQ9JHK4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RabggtaQ9JHK4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RabggtaQ9JHK4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RabggtaQ9JHK4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
RabggtaQ9JHK4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RabggtaQ9JHK4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RabggtaQ9JHK4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RabggtaQ9JHK4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RabggtaQ9JHK4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RabggtaQ9JHK4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RabggtaQ9JHK4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
RabggtaQ9JHK4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RabggtaQ9JHK4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RabggtaQ9JHK4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RabggtaQ9JHK4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RabggtaQ9JHK4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RabggtaQ9JHK4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RabggtaQ9JHK4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RabggtaQ9JHK4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RabggtaQ9JHK4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RabggtaQ9JHK4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RabggtaQ9JHK4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
RabggtaQ9JHK4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RabggtaQ9JHK4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RabggtaQ9JHK4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RabggtaQ9JHK4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
RabggtaQ9JHK4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
RabggtaQ9JHK4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
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