Protein–RNA interactions for Protein: Q61092

Lamc2, Laminin subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc2Q61092 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46.03■■■■■ 4.96
Lamc2Q61092 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Lamc2Q61092 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Lamc2Q61092 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
Lamc2Q61092 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
Lamc2Q61092 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
Lamc2Q61092 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Lamc2Q61092 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Lamc2Q61092 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Lamc2Q61092 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Lamc2Q61092 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
Lamc2Q61092 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Lamc2Q61092 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Lamc2Q61092 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Lamc2Q61092 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Lamc2Q61092 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Lamc2Q61092 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Lamc2Q61092 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Lamc2Q61092 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Lamc2Q61092 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Lamc2Q61092 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Lamc2Q61092 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Lamc2Q61092 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Lamc2Q61092 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Lamc2Q61092 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Lamc2Q61092 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Lamc2Q61092 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Lamc2Q61092 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Lamc2Q61092 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Lamc2Q61092 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Lamc2Q61092 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Lamc2Q61092 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Lamc2Q61092 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Lamc2Q61092 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
Lamc2Q61092 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Lamc2Q61092 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Lamc2Q61092 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
Lamc2Q61092 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Lamc2Q61092 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Lamc2Q61092 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Lamc2Q61092 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Lamc2Q61092 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Lamc2Q61092 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Lamc2Q61092 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Lamc2Q61092 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Lamc2Q61092 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Lamc2Q61092 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Lamc2Q61092 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Lamc2Q61092 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Lamc2Q61092 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Lamc2Q61092 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Lamc2Q61092 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Lamc2Q61092 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Lamc2Q61092 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Lamc2Q61092 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Lamc2Q61092 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Lamc2Q61092 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Lamc2Q61092 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Lamc2Q61092 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Lamc2Q61092 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Lamc2Q61092 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Lamc2Q61092 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Lamc2Q61092 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Lamc2Q61092 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Lamc2Q61092 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Lamc2Q61092 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Lamc2Q61092 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Lamc2Q61092 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Lamc2Q61092 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Lamc2Q61092 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Lamc2Q61092 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Lamc2Q61092 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Lamc2Q61092 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Lamc2Q61092 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Lamc2Q61092 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Lamc2Q61092 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Lamc2Q61092 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Lamc2Q61092 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Lamc2Q61092 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Lamc2Q61092 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Lamc2Q61092 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Lamc2Q61092 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Lamc2Q61092 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Lamc2Q61092 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Lamc2Q61092 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Lamc2Q61092 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Lamc2Q61092 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Lamc2Q61092 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Lamc2Q61092 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Lamc2Q61092 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Lamc2Q61092 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Lamc2Q61092 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Lamc2Q61092 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Lamc2Q61092 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Lamc2Q61092 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Lamc2Q61092 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Lamc2Q61092 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
Lamc2Q61092 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Lamc2Q61092 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Lamc2Q61092 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.1 ms