Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45.25■■■■■ 4.83
SelpQ01102 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
SelpQ01102 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
SelpQ01102 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
SelpQ01102 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
SelpQ01102 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
SelpQ01102 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SelpQ01102 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
SelpQ01102 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
SelpQ01102 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
SelpQ01102 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
SelpQ01102 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
SelpQ01102 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SelpQ01102 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SelpQ01102 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
SelpQ01102 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
SelpQ01102 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SelpQ01102 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SelpQ01102 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SelpQ01102 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SelpQ01102 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SelpQ01102 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SelpQ01102 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SelpQ01102 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
SelpQ01102 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SelpQ01102 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SelpQ01102 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SelpQ01102 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
SelpQ01102 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SelpQ01102 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SelpQ01102 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SelpQ01102 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SelpQ01102 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SelpQ01102 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SelpQ01102 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SelpQ01102 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
SelpQ01102 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SelpQ01102 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SelpQ01102 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SelpQ01102 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
SelpQ01102 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SelpQ01102 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SelpQ01102 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
SelpQ01102 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SelpQ01102 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SelpQ01102 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SelpQ01102 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
SelpQ01102 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SelpQ01102 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SelpQ01102 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
SelpQ01102 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SelpQ01102 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SelpQ01102 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SelpQ01102 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.81■■■■□ 3
SelpQ01102 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SelpQ01102 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SelpQ01102 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SelpQ01102 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
SelpQ01102 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SelpQ01102 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
SelpQ01102 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SelpQ01102 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SelpQ01102 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SelpQ01102 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SelpQ01102 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SelpQ01102 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SelpQ01102 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SelpQ01102 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SelpQ01102 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SelpQ01102 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SelpQ01102 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SelpQ01102 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SelpQ01102 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SelpQ01102 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SelpQ01102 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SelpQ01102 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SelpQ01102 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SelpQ01102 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SelpQ01102 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SelpQ01102 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SelpQ01102 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SelpQ01102 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SelpQ01102 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
SelpQ01102 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SelpQ01102 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SelpQ01102 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SelpQ01102 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SelpQ01102 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SelpQ01102 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SelpQ01102 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SelpQ01102 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SelpQ01102 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SelpQ01102 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SelpQ01102 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SelpQ01102 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SelpQ01102 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
SelpQ01102 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
SelpQ01102 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SelpQ01102 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SelpQ01102 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms