RNA–Protein interactions for RNA: YPL147W

PXA1, Transcript of Subunit of a heterodimeric peroxisomal ABC transport complex, yeast

Gene PXA1, Length 2,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria, Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PXA1	YPL147W	ARG81	P05085	880 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PXA1	YPL147W	GAL7	P08431	366 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PXA1	YPL147W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PXA1	YPL147W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PXA1	YPL147W	SEC62	P21825	274 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PXA1	YPL147W	CWH43	P25618	953 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PXA1	YPL147W	KRE2	P27809	442 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PXA1	YPL147W	HSP78	P33416	811 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PXA1	YPL147W	MTH1	P35198	433 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PXA1	YPL147W	ECL1	P48235	211 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PXA1	YPL147W	ZIP2	P53061	704 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PXA1	YPL147W	RPN14	P53196	417 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PXA1	YPL147W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PXA1	YPL147W	KAP120	Q02932	1032 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PXA1	YPL147W	RMT2	Q03305	412 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PXA1	YPL147W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PXA1	YPL147W	VAM6	Q07468	1049 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PXA1	YPL147W	RBD2	Q12270	262 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PXA1	YPL147W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	CLB1	P24868	471 aa		5.09	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	PAH1	P32567	862 aa		5.09	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	BEM3	P32873	1128 aa		5.09	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	MSN4	P33749	630 aa		5.09	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	VPS35	P34110	944 aa		5.09	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	KTR4	P38131	464 aa		5.09	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	YJL068C	P40363	299 aa		5.09	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	VPS53	P47061	822 aa		5.09	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	TAF4	P50105	388 aa		5.09	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	YPL109C	Q02981	657 aa		5.09	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	SGO1	Q08490	590 aa		5.09	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	YOR296W	Q08748	1289 aa		5.09	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	SEG2	P34250	1132 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	CAF4	P36130	643 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	YBR242W	P38331	238 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	APM2	P38700	605 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	OSW5	P40219	148 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	QDR1	P40475	563 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	HIS6	P40545	261 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	DOT5	P40553	215 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	CIN5	P40917	295 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	LCB2	P40970	561 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	CIR1	P42940	261 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	CAF120	P53836	1060 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	RTT103	Q05543	409 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	VPH2	P32341	215 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	COX16	P47081	118 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	YNR068C	P53754	272 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	TOF2	Q02208	771 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	SPP1	Q03012	353 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	FCP1	Q03254	732 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	DML1	Q03652	475 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	HFD1	Q04458	532 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	MRX10	Q05648	414 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	YDL114W	Q07530	308 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	SPO75	Q07798	868 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	RRT8	Q08219	342 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	YDL109C	Q12103	647 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	LAG2	Q92325	660 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	FKS3	Q04952	1785 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	PSK1	P31374	1356 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	JIP3	O13555	125 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.07	□□□□□ -1.6	not detected
PXA1	YPL147W	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	BAS1	P22035	811 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	ROX1	P25042	368 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	SED4	P25365	1065 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	SDS22	P36047	338 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	YHL041W	P38730	149 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	PRM9	P39551	298 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	ASE1	P50275	885 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	GYL1	Q04322	720 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	RGA2	Q06407	1009 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	TY3A-G	Q12173	290 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	GYP5	Q12344	894 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	TY3A-I	Q99219	290 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	TRP3	P00937	484 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	YAK1	P14680	807 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	BDF1	P35817	686 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	PEX28	P38848	579 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	MNL1	P38888	796 aa		5.07	□□□□□ -1.6

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