RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	VFA1	P40080	203 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	YIR042C	P40586	236 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	YGL138C	P53122	345 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	MET13	P53128	600 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	GPG1	P53130	126 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	YLR287C	Q05881	355 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	TRE2	Q08693	809 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	NUR1	Q12066	484 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	RMP1	Q12530	201 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	YOR111W	Q99210	232 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	MYO1	P08964	1928 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	CKI1	P20485	582 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	COQ2	P32378	372 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	HOG1	P32485	435 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	MCD4	P36051	919 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	TAT1	P38085	619 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	SMF1	P38925	575 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	CSM2	P40465	213 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	THI6	P41835	540 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	HFM1	P51979	1187 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	MTC3	P53077	123 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	SFB2	P53953	876 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	SDH1	Q00711	640 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	VPS30	Q02948	557 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	NGL3	Q03210	505 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	FOB1	O13329	566 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	SPO12	P17123	173 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	RAD57	P25301	460 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	HXT1	P32465	570 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	AIM26	P32858	118 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	NPP2	P39997	493 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	VTC2	P43585	828 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	ALY2	P47029	1046 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	YJR120W	P47157	116 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.07	□□□□□ -1.44	not detected
PSH1	YOL054W	PSR2	Q07949	397 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	PLP2	Q12017	286 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	SPS1	P08458	490 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	DAL7	P21826	554 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	RIT1	P23796	513 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	PSO2	P30620	661 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	TDA3	P38758	523 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	DSN1	P40568	576 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	PXA1	P41909	870 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	MIC19	P43594	170 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	YJR096W	P47137	282 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	RET3	P53600	189 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.06	□□□□□ -1.44	not detected
PSH1	YOL054W	TRE1	Q08919	783 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	GUP2	Q08929	609 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	PSF3	Q12146	194 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	RAD61	Q99359	647 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	HKR1	P41809	1802 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	CDC8	P00572	216 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	SAF1	P38352	637 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	SPL2	P38839	148 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	CKB2	P38930	258 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	TY4A-J	P47023	414 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	YJR079W	P47126	109 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	YGR153W	P48238	217 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	TAD1	P53065	400 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	PEX8	P53248	589 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	NHX1	Q04121	633 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	SFH1	Q06168	426 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	OPY2	Q06810	360 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	YAP7	Q08182	245 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	DAS2	Q12084	232 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	EUG1	P32474	517 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	YBR071W	P38243	211 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	ERG7	P38604	731 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	YAP1801	P38856	637 aa		6.04	□□□□□ -1.44

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