RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	SLY1	P22213	666 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.36	□□□□□ -0.59	not detected
DDR2	YOL052C-A	MEI4	P29467	408 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	PLC1	P32383	869 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.36	□□□□□ -0.59	not detected
DDR2	YOL052C-A	POP4	P38336	279 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	CIN4	P39110	191 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	TGL3	P40308	642 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	RNT1	Q02555	471 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.36	□□□□□ -0.59	RIP-Chip
DDR2	YOL052C-A	THI21	Q08975	551 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	YLR422W	Q06409	1932 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	ADH4	P10127	382 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	RPC37	P36121	282 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	YBR053C	P38235	358 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	RGD2	P43556	714 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	TAF1	P46677	1066 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	YJL045W	P47052	634 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	YML083C	Q04526	418 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	PRM6	Q04705	352 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	NBP2	Q12163	236 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	PEP7	P32609	515 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	YME1	P32795	747 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	HSL7	P38274	827 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	FLC2	P39719	783 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	NUT1	P53114	1132 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	PEX31	P53203	462 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	ADA2	Q02336	434 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	RKM2	Q03942	479 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	PIB1	Q06651	286 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	SEY1	Q99287	776 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	RAD1	P06777	1100 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	GCR1	P07261	785 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	AVT2	P39981	480 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	YFL052W	P43551	465 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	VPS25	P47142	202 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	SND1	Q04007	877 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	DDC1	Q08949	612 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	APM4	Q99186	491 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	RGR1	P19263	1082 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	JHD1	P40034	492 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	PRK1	P40494	810 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	CDC1	P40986	491 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	BFA1	P47113	574 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	SPP1	Q03012	353 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	TPO1	Q07824	586 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	ACM1	Q08981	209 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	IZH4	Q99393	312 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	YCR015C	P25616	317 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	MSC7	P38694	644 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	FHL1	P39521	936 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	PXA1	P41909	870 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	GUF1	P46943	645 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	RFX1	P48743	811 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	FRA1	Q07825	749 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	HRT3	Q12347	344 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	AVL9	Q12500	764 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	SSP1	P38871	571 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	SAW1	P39735	261 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	VTC4	P47075	721 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	MSH6	Q03834	1242 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	AIM32	Q04689	311 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	HRD3	Q05787	833 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	CDC73	Q06697	393 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	CBF1	P17106	351 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	DUG2	P38149	878 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	PRM9	P39551	298 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	ATG36	P46983	293 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	COG6	P53959	839 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	SHR3	Q02774	210 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	YMR027W	Q04371	470 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	OMS1	Q06668	471 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	AAD4	Q07747	329 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	RRD2	Q12461	358 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	CCP1	P00431	361 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	MGT1	P26188	188 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	RAD27	P26793	382 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	DSS4	P32601	143 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDR2	YOL052C-A	GCS1	P35197	352 aa		11.28	□□□□□ -0.6

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