RNA–Protein interactions for RNA: YNL171C

YNL171C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL171C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL171C	YNL171C	SPO1	P53541	631 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	SND1	Q04007	877 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	AFT2	Q08957	416 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	ADY2	P25613	283 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	YIL166C	P40445	542 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	RFX1	P48743	811 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	PEX8	P53248	589 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	FHN1	P53279	174 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	THI7	Q05998	598 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	YFT2	Q06676	274 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	MLH3	Q12083	715 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	PRE4	P30657	266 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	NTH1	P32356	751 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	HOL1	P53389	586 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	HOF1	Q05080	669 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	ABF1	P14164	731 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	MPS3	P47069	682 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	YNL034W	P53963	612 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	YNL018C	P53976	612 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	USV1	Q12132	391 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	YEL076C	P39971	216 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	NDC80	P40460	691 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	PRM2	P40534	656 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	IRC5	P43610	853 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	ATG4	P53867	494 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	SLX4	Q12098	748 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	EMP70	P32802	667 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
YNL171C	YNL171C	EAF5	P39995	279 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	KHA1	P40309	873 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	ARG2	P40360	574 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	CTR1	P49573	406 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	YGR151C	P53287	111 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	TGL2	P54857	326 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	AIM41	Q12032	185 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	MPD2	Q99316	277 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	FUB1	P25659	250 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	CTP1	P38152	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	YJL206C	P39529	758 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	TMN3	P40071	706 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	FTR1	P40088	404 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	FDC1	Q03034	503 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	YOL057W	Q08225	711 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	TAF3	Q12297	353 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL171C	YNL171C	HMG2	P12684	1045 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	TUP1	P16649	713 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	NIC96	P34077	839 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	SET3	P36124	751 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	GLG1	P36143	616 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	CDS1	P38221	457 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	STL1	P39932	569 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	YJR008W	P47085	338 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	HLR1	Q04429	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	YCG1	Q06680	1035 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	YAP7	Q08182	245 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	ICT1	Q12385	394 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	VPS5	Q92331	675 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	DMC1	P25453	334 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	MTC7	P32633	139 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	PEF1	P53238	335 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	MDR1	P53258	950 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	TIM50	Q02776	476 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	IZH3	Q07959	543 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	ELF1	P36053	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	APL3	P38065	1025 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	UBS1	P38290	277 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	YIL092W	P40497	633 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	NUR1	Q12066	484 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	NYV1	Q12255	253 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	PHO3	P24031	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	CWH43	P25618	953 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	GMH1	P36125	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	EHT1	P38295	451 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	PPE1	P38796	400 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	SAW1	P39735	261 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	YEL025C	P39991	1188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 38.2 ms