RNA–Protein interactions for RNA: YMR088C

VBA1, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA1	YMR088C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	RBA50	Q04418	439 aa		5.7	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	REH1	Q06709	432 aa		5.7	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	NDE2	Q07500	545 aa		5.7	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	YOR296W	Q08748	1289 aa		5.7	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	SCM3	Q12334	223 aa		5.7	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	YOR131C	Q12486	218 aa		5.7	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	IRC20	Q06554	1556 aa		5.7	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	FBP1	P09201	348 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	ENA1	P13587	1091 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	AFT1	P22149	690 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	KRE2	P27809	442 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	VPS17	P32913	551 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	ASH1	P34233	588 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	CHK1	P38147	527 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	APM3	P38153	483 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	HXT7	P39004	570 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	SSO2	P39926	295 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	TED1	P40533	473 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	ROG3	P43602	733 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	MDE1	P47095	244 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	YJR039W	P47107	1121 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	YJR107W	P47145	328 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	DSE4	P53753	1117 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	RCM1	P53972	490 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	ENA2	Q01896	1091 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	MFM1	Q02783	413 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	GYL1	Q04322	720 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	YPQ2	Q06328	317 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	DAS2	Q12084	232 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	SPO21	Q12411	609 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	ENA5	Q12691	1091 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	YOS9	Q99220	542 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	TRP3	P00937	484 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	BIK1	P11709	440 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	IDI1	P15496	288 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	PHO3	P24031	467 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	HSP30	P25619	332 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	APL1	P27351	700 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	HMX1	P32339	317 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	SCT1	P32784	759 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	OCT1	P35999	772 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	SEA4	P38164	1038 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	FTH1	P38310	465 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	YIL077C	P40508	320 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	5.69	□□□□□ -1.5	not detected
VBA1	YMR088C	MDJ2	P42834	146 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	NIT3	P49954	291 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	NCS6	P53088	359 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	SPC105	P53148	917 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	HST3	P53687	447 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	IRC4	Q03036	179 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	NTG2	Q08214	380 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	SIN3	P22579	1536 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	HSL1	P34244	1518 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	MET8	P15807	274 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	NAM9	P27929	486 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	NUP133	P36161	1157 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	MRX3	P38172	270 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	YBR197C	P38306	217 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	YRB2	P40517	327 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	RTS2	P40962	232 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	GNP1	P48813	663 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	YGL117W	P53133	265 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	RPN14	P53196	417 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	TOF1	P53840	1238 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	CAB1	Q04430	367 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	YCG1	Q06680	1035 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	GRS2	Q06817	618 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	YLR031W	Q07978	186 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	RSA1	Q08932	381 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	AEP3	Q12089	606 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	BBP1	Q12365	385 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	LAM4	P38800	1345 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	BI4	P03879	638 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	PHO8	P11491	566 aa		5.67	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 207.3 ms