RNA–Protein interactions for RNA: YMR054W

STV1, Transcript of Subunit a of the vacuolar-ATPase V0 domain, yeast

Gene STV1, Length 2,673 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STV1	YMR054W	SOG2	Q08817	791 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	PSF3	Q12146	194 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	GRX6	Q12438	231 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	NUP159	P40477	1460 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	CDC4	P07834	779 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
STV1	YMR054W	BET2	P20133	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	IME2	P32581	645 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	YKR018C	P36114	725 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	BEM4	P39011	633 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	PEX25	Q02969	394 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	RMT2	Q03305	412 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	HAP1	P0CE41	1502 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	PET123	P17558	318 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	APN1	P22936	367 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	STE50	P25344	346 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	DAL80	P26343	269 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	RTT105	P40063	208 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	YJL181W	P46987	611 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	TIM50	Q02776	476 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	SWA2	Q06677	668 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	TGL5	Q12043	749 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	FRE6	Q12473	712 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	MMS22	Q06164	1454 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	BUD3	P25558	1636 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	PHO5	P00635	467 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	SIR1	P21691	654 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	CLB4	P24871	460 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	SPT23	P35210	1082 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	UIP5	P36137	443 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	GIC1	P38785	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	PSD1	P39006	500 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	PIK1	P39104	1066 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	GYP7	P48365	746 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	NGL3	Q03210	505 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	KIP1	P28742	1111 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	FET4	P40988	552 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	FET5	P43561	622 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	MNT2	P53059	558 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	YNR061C	P53747	219 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	YNR068C	P53754	272 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	YSA1	Q01976	231 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	LDB19	Q12502	818 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	SWC3	P31376	625 aa		4.53	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	PRO1	P32264	428 aa		4.53	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	GCS1	P35197	352 aa		4.53	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	UGA2	P38067	497 aa		4.53	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	SIF2	P38262	535 aa		4.53	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	FTH1	P38310	465 aa		4.53	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	DSD1	P53095	428 aa		4.53	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	YNR071C	P53757	342 aa		4.53	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	SKS1	Q12505	502 aa		4.53	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.53	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.53	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	POL3	P15436	1097 aa		4.53	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	MSC7	P38694	644 aa		4.53	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	YEL076C	P39971	216 aa		4.53	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	YEL057C	P39983	233 aa		4.53	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	PSF2	P40359	213 aa		4.53	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	YFL052W	P43551	465 aa		4.53	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	SFB2	P53953	876 aa		4.53	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	VPS9	P54787	451 aa		4.53	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	OAZ1	Q02803	292 aa		4.53	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	APC5	Q08683	685 aa		4.53	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	DNF3	Q12674	1656 aa		4.53	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
STV1	YMR054W	PCH2	P38126	564 aa		4.52	□□□□□ -1.69
STV1	YMR054W	RTS1	P38903	757 aa		4.52	□□□□□ -1.69
STV1	YMR054W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
STV1	YMR054W	HFM1	P51979	1187 aa		4.52	□□□□□ -1.69
STV1	YMR054W	NNF2	P53253	936 aa		4.52	□□□□□ -1.69
STV1	YMR054W	SEC5	P89102	971 aa		4.52	□□□□□ -1.69
STV1	YMR054W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69

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