RNA–Protein interactions for RNA: YML114C

TAF8, Transcript of TFIID subunit (65 kDa), yeast

Gene TAF8, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TAF8	YML114C	NDC80	P40460	691 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	SNM1	P40993	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	RPN4	Q03465	531 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	TAF3	Q12297	353 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	CEX1	Q12453	761 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	FOB1	O13329	566 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	DPB3	P27344	201 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	BRF1	P29056	596 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	GDH3	P39708	457 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	ARG2	P40360	574 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	YFL052W	P43551	465 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	CTR1	P49573	406 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	YDR338C	Q05497	695 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	PHM6	Q05637	104 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	ARO10	Q06408	635 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	IRC3	Q06683	689 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	YOR131C	Q12486	218 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	PDR11	P40550	1411 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	ADY2	P25613	283 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	GLG1	P36143	616 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
TAF8	YML114C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	BNA2	P47125	453 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	YGR021W	P53212	290 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	MTL1	P53214	551 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	CDC45	Q08032	650 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	RPN13	O13563	156 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	SPO11	P23179	398 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	MTC2	P34246	357 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	YHR112C	P38716	378 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	YHR218W	P38899	603 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	NUP60	P39705	539 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	VID27	P40157	782 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	PEX8	P53248	589 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	ATG16	Q03818	150 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	MCM21	Q06675	368 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	GRC3	Q07845	632 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	SFB3	P38810	929 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	FMO1	P38866	432 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	NPY1	P53164	384 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	FOL1	P53848	824 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	YPR172W	Q06608	200 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	FLO10	P36170	1169 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	RKM3	P38222	552 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	BDH2	P39713	417 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	IES5	P40060	125 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	ATG4	P53867	494 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	VTI1	Q04338	217 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	PSR1	Q07800	427 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	ENT1	Q12518	454 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	YRF1-2	P40105	1681 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TAF8	YML114C	ANP1	P32629	500 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TAF8	YML114C	SAS3	P34218	831 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TAF8	YML114C	MCD4	P36051	919 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TAF8	YML114C	PIM1	P36775	1133 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TAF8	YML114C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TAF8	YML114C	REC102	Q02721	264 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TAF8	YML114C	HOF1	Q05080	669 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TAF8	YML114C	RRI2	Q12348	645 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TAF8	YML114C	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TAF8	YML114C	MSM1	P22438	575 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TAF8	YML114C	LYS9	P38999	446 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TAF8	YML114C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TAF8	YML114C	CAF16	P43569	289 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TAF8	YML114C	APC5	Q08683	685 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TAF8	YML114C	PIF1	P07271	859 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TAF8	YML114C	HOM3	P10869	527 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TAF8	YML114C	GSY1	P23337	708 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TAF8	YML114C	MRC1	P25588	1096 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TAF8	YML114C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TAF8	YML114C	PHO11	P35842	467 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TAF8	YML114C	RXT2	P38255	430 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TAF8	YML114C	PAF1	P38351	445 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TAF8	YML114C	PHO12	P38693	467 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TAF8	YML114C	APE4	P38821	490 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TAF8	YML114C	YEL020C	P39994	560 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TAF8	YML114C	FHN1	P53279	174 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TAF8	YML114C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69

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