RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W HFM1P51979 1187 aa9.65□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W GPD1Q00055 391 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W NAM8Q00539 523 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W TRS33Q99394 268 aa9.65□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W SFP1P32432 683 aa9.64□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W LTP1P40347 161 aa9.64□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W DRN1P53255 507 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W ARO80Q04052 950 aa9.64□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W PMT7Q06644 662 aa9.64□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W SVS1Q12254 260 aa9.64□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W ARP7Q12406 477 aa9.64□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W BIK1P11709 440 aa9.63□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W PYC2P32327 1180 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W SAK1P38990 1142 aa9.63□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W YCS4Q06156 1176 aa9.63□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W OPI10Q08202 246 aa9.63□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W HFA1P32874 2273 aa9.62□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W CCP1P00431 361 aa9.62□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W ADE3P07245 946 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W TEC1P18412 486 aa9.62□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data9.62□□□□□ -0.87not detected
YLR349WYLR349W URA8P38627 578 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W YEL075CP39972 122 aa9.62□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W YJR079WP47126 109 aa9.62□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W TAF9Q05027 157 aa9.62□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W LCB5Q06147 687 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W HMI1Q12039 706 aa9.62□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W JIP3O13555 125 aa9.61□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W PMI40P29952 429 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W CSG2P35206 410 aa9.61□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W YMC2P38087 329 aa9.61□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W YBR238CP38330 731 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W CRP1P38845 465 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W EXO1P39875 702 aa9.61□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W YER158CP40095 573 aa9.61□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W STU2P46675 888 aa9.61□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W PRP24P49960 444 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W RSC1P53236 928 aa9.61□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W VMS1Q04311 632 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W PEX15Q08215 383 aa9.61□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data9.6□□□□□ -0.87not detected
YLR349WYLR349W RPC31P17890 251 aa9.6□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W WBP1P33767 430 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W CBR1P38626 284 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W DYS1P38791 387 aa9.6□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W UME6P39001 836 aa9.6□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W ERV46P39727 415 aa9.6□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W BST1P43571 1029 aa9.6□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W SUM1P46676 1062 aa9.6□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W APC5Q08683 685 aa9.6□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W AFT2Q08957 416 aa9.6□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W PER33Q12144 273 aa9.6□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data9.6□□□□□ -0.87not detected
YLR349WYLR349W COX3P00420 269 aa9.59□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W SEC6P32844 805 aa9.59□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W YHR078WP38799 552 aa9.59□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W CTM1P38818 585 aa9.59□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W COS5P47187 383 aa9.59□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W YLR297WQ05899 129 aa9.59□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W YFT2Q06676 274 aa9.59□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W NAG1Q8TGN9 163 aa9.59□□□□□ -0.87
YLR349WYLR349W RPL1AP0CX43 217 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W RPL1BP0CX44 217 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W ERG6P25087 383 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W YIH1P25637 258 aa9.58□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W IML2P47031 731 aa9.58□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W YGR237CP50089 785 aa9.58□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W SUN4P53616 420 aa9.58□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W AIM32Q04689 311 aa9.58□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W HRQ1Q05549 1077 aa9.58□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W CSR1Q06705 408 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W SAM4Q08985 325 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W EMP46Q12396 444 aa9.58□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W AEP2P22136 580 aa9.57□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W PXA2P34230 853 aa9.57□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W MRPL40P36534 297 aa9.57□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W AIP1P46680 615 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W RTT101P47050 842 aa9.57□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W NRM1P53718 249 aa9.57□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W SNO2P53823 222 aa9.57□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W COG4Q06096 861 aa9.57□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W YAP7Q08182 245 aa9.57□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W CLP1Q08685 445 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W RKM5Q12367 367 aa9.57□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W PPR1P07272 904 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W YER152CP10356 443 aa9.56□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W RPC25P35718 212 aa9.56□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W HSL7P38274 827 aa9.56□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W PPE1P38796 400 aa9.56□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W REF2P42073 533 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W AIM23P47015 356 aa9.56□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W TAN1P53072 289 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W YGL140CP53120 1219 aa9.56□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W COP1P53622 1201 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W SWS2P53937 143 aa9.56□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W YLR456WQ06199 204 aa9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 40 ms