RNA–Protein interactions for RNA: YKR070W

YKR070W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKR070W, Length 1,059 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR070W	YKR070W	ATG2	P53855	1592 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	IME1	P21190	360 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	SPO11	P23179	398 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	GRX4	P32642	244 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	YPT7	P32939	208 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	FAT1	P38225	669 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	YHR033W	P38690	423 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	TAH11	P47112	604 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	TRE2	Q08693	809 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	APM4	Q99186	491 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	DIP5	P53388	608 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	NSE5	Q03718	556 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	SGS1	P35187	1447 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YKR070W	YKR070W	RPN13	O13563	156 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	DAL3	P32459	195 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	ELF1	P36053	145 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	UBS1	P38290	277 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	PEA2	P40091	420 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	IES1	P43579	692 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	LAM4	P38800	1345 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	YOR093C	Q12275	1648 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	AEP2	P22136	580 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	PRE4	P30657	266 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	EUG1	P32474	517 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	TMN3	P40071	706 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	SPC105	P53148	917 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	SKY1	Q03656	742 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	AIM41	Q12032	185 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	DRS2	P39524	1355 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	THI6	P41835	540 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	PMT6	P42934	759 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	UFO1	Q04511	668 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	RKI1	Q12189	258 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	SUT2	Q12286	268 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
YKR070W	YKR070W	TMA17	Q12513	150 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	CDC26	P14724	124 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	PPE1	P38796	400 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	YEL020C	P39994	560 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	FDC1	Q03034	503 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	IZH3	Q07959	543 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	DNF2	Q12675	1612 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	STE12	P13574	688 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.73	□□□□□ -1.65	not detected
YKR070W	YKR070W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	PEX2	P32800	271 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	MUP3	P38734	546 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.73	□□□□□ -1.65	not detected
YKR070W	YKR070W	FTR1	P40088	404 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	PRM2	P40534	656 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	SLD3	P53135	668 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	TIM50	Q02776	476 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	RKR1	Q04781	1562 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	TUP1	P16649	713 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	EMP70	P32802	667 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	YBR071W	P38243	211 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	YJR120W	P47157	116 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	MFM1	Q02783	413 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	TRS23	Q03784	219 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR070W	YKR070W	KAR1	P11927	433 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR070W	YKR070W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YKR070W	YKR070W	ATP12	P22135	325 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR070W	YKR070W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YKR070W	YKR070W	ADY2	P25613	283 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR070W	YKR070W	HXT4	P32467	576 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR070W	YKR070W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YKR070W	YKR070W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YKR070W	YKR070W	NIT2	P47016	307 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR070W	YKR070W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YKR070W	YKR070W	HLR1	Q04429	423 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR070W	YKR070W	BNR1	P40450	1375 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YKR070W	YKR070W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YKR070W	YKR070W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YKR070W	YKR070W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YKR070W	YKR070W	EMP65	P40085	556 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YKR070W	YKR070W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YKR070W	YKR070W	ATF1	P40353	525 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YKR070W	YKR070W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YKR070W	YKR070W	MDR1	P53258	950 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YKR070W	YKR070W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YKR070W	YKR070W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.1 ms