RNA–Protein interactions for RNA: YJR143C

PMT4, Transcript of Protein O-mannosyltransferase, yeast

Gene PMT4, Length 2,289 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PMT4	YJR143C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	RTG1	P32607	177 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	MEF2	P39677	819 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	YEL076C	P39971	216 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	YFL054C	P43549	646 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	FET5	P43561	622 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	AGX1	P43567	385 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	SPO1	P53541	631 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	TOF1	P53840	1238 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	YSA1	Q01976	231 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	NGL3	Q03210	505 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	ARV1	Q06541	321 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	MLH2	Q07980	695 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	SAC3	P46674	1301 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	MRP10	O75012	95 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	TPK1	P06244	397 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	MGM1	P32266	881 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	YKR018C	P36114	725 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	PCH2	P38126	564 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	HSM3	P38348	480 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	YHR131C	P38835	850 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	PIK1	P39104	1066 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	BUD16	P39988	312 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	FET4	P40988	552 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	RAD17	P48581	401 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	VTC3	Q02725	835 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	GYL1	Q04322	720 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	GTB1	Q04924	702 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	PSY3	Q12318	242 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	HNM1	P19807	563 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	PRO1	P32264	428 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	GYP6	P32806	458 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	MDL2	P33311	773 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	MAC1	P35192	417 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	STB6	P36085	766 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	UME6	P39001	836 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	OSW5	P40219	148 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	EFM4	P40516	257 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	THI6	P41835	540 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	GYP7	P48365	746 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	ALT1	P52893	592 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	GAD1	Q04792	585 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	APL4	Q12028	832 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	OM45	P16547	393 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	SDH2	P21801	266 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	BCK2	P33306	851 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	SPT23	P35210	1082 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	RIP-Chip
PMT4	YJR143C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	VTC4	P47075	721 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	MTC3	P53077	123 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	SNF12	P53628	566 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	YNR071C	P53757	342 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	AMS1	P22855	1083 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	BEM4	P39011	633 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	YEL057C	P39983	233 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	YJR061W	P40355	935 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	MNT2	P53059	558 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	YLR407W	Q06070	228 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	SOG2	Q08817	791 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	CTI6	Q08923	506 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	PHM7	Q12252	991 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	CDC4	P07834	779 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	CLB1	P24868	471 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	MSC7	P38694	644 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	LYS9	P38999	446 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	CRR1	Q05790	422 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	ZRT2	Q12436	422 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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