RNA–Protein interactions for RNA: YGR089W

NNF2, Transcript of Protein that exhibits physical and genetic interactions with Rpb8p, yeast

Gene NNF2, Length 2,811 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NNF2	YGR089W	PCL10	P53124	433 aa		0.96	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	YGL117W	P53133	265 aa		0.96	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	BOP3	P53958	396 aa		0.96	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	RSC9	Q03124	581 aa		0.96	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	NHX1	Q04121	633 aa		0.96	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	YDL073W	Q07454	984 aa		0.96	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	ECM3	Q99252	613 aa		0.96	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	CIT2	P08679	460 aa		0.95	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	MSH2	P25847	964 aa		0.95	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	HOG1	P32485	435 aa		0.95	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	TRS23	Q03784	219 aa		0.95	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	RAD18	P10862	487 aa		0.95	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	PHO8	P11491	566 aa		0.95	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	HMG1	P12683	1054 aa		0.95	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	GSY1	P23337	708 aa		0.95	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	SEC6	P32844	805 aa		0.95	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	APN2	P38207	520 aa		0.95	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	KHA1	P40309	873 aa		0.95	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	YIL077C	P40508	320 aa		0.95	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	PIP2	P52960	996 aa		0.95	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	AIM14	P53109	570 aa		0.95	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	THI22	Q06490	572 aa		0.95	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	YLR125W	Q12138	136 aa		0.95	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	PCL2	P25693	308 aa		0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	ATO2	P32907	282 aa		0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	MNN4	P36044	1178 aa		0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	YBR139W	P38109	508 aa		0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	OPT1	P40897	799 aa		0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	FCP1	Q03254	732 aa		0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	ATG33	Q06485	197 aa		0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	SRL1	Q08673	210 aa		0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	FRE7	Q12333	620 aa		0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	BI2	P03873	423 aa		0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	PMA2	P19657	947 aa		0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	KIN82	P25341	720 aa		0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	THI4	P32318	326 aa		0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	MDV1	P47025	714 aa		0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	YJR039W	P47107	1121 aa		0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	RFX1	P48743	811 aa		0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	YPL071C	Q02864	156 aa		0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	UGO1	Q03327	502 aa		0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	BSP1	Q06604	576 aa		0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	NTG2	Q08214	380 aa		0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	YPL216W	Q08964	1102 aa		0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	DCS2	Q12123	353 aa		0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	IRC20	Q06554	1556 aa		0.94	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	SFL1	P20134	766 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	YPT7	P32939	208 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	SCO2	P38072	301 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	MET30	P39014	640 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	VRG4	P40107	337 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	MFM1	Q02783	413 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	YLR001C	Q07895	862 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	GIN4	Q12263	1142 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	POM34	Q12445	299 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	SWR1	Q05471	1514 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	WHI2	P12611	486 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	ELF1	P36053	145 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	COS111	P38308	924 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	YHR202W	P38887	602 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	BEM4	P39011	633 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	YIL024C	P40543	189 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	SAD1	P43589	448 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	MET13	P53128	600 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	COG8	Q04632	607 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	TPO3	Q06451	622 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	AQY1	P0CD91	305 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	MRPL7	P36519	292 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	CFD1	P40558	293 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	SKP2	P42843	763 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	BIT61	P47041	543 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	BFA1	P47113	574 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	COQ6	P53318	479 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	SNF12	P53628	566 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	YNL058C	P53947	316 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	NRT1	Q08485	598 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	TGS1	Q12052	315 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NNF2	YGR089W	UBX3	Q12229	455 aa		0.93	□□□□□ -2.26

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