RNA–Protein interactions for RNA: YFL036W

RPO41, Transcript of Mitochondrial RNA polymerase, yeast

Gene RPO41, Length 4,056 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPO41	YFL036W	OMS1	Q06668	471 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	ZRT2	Q12436	422 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.75	□□□□□ -1.97	RIP-Chip
RPO41	YFL036W	VPS3	P23643	1011 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	CSG2	P35206	410 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	ARG2	P40360	574 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	MND1	P53102	219 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	TAM41	P53230	385 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	YNL146W	P53906	100 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	SHR3	Q02774	210 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	ATG23	Q06671	453 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	YDL121C	Q07541	149 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	SEY1	Q99287	776 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	HAP2	P06774	265 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	CLB3	P24870	427 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	ARE1	P25628	610 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	PCA1	P38360	1216 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	LCB2	P40970	561 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	BRE2	P43132	505 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	IES1	P43579	692 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	YJL132W	P47014	750 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.74	□□□□□ -1.97	not detected
RPO41	YFL036W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	MCD1	Q12158	566 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	SFL1	P20134	766 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	MRPL25	P23369	157 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	RAD57	P25301	460 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	MSC7	P38694	644 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	INA22	P40576	216 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	YOL098C	Q12496	1037 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	VPS5	Q92331	675 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	DUR3	P33413	735 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	POP4	P38336	279 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	LYS9	P38999	446 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	ERP2	P39704	215 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	ESL1	P40456	1118 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	PHO86	P46956	311 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	IML2	P47031	731 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	VPS25	P47142	202 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	RTS3	P53289	263 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	RCF2	P53721	224 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	YNR040W	P53736	256 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	BOP3	P53958	396 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	SLT2	Q00772	484 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	MET14	Q02196	202 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	TRS130	Q03660	1102 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	ADY3	Q07732	790 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	SPO12	P17123	173 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	GLN3	P18494	730 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	HXT5	P38695	592 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	YHL041W	P38730	149 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	PRM9	P39551	298 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	TMA108	P40462	946 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	LSB6	P42951	607 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	TAF1	P46677	1066 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	INP52	P50942	1183 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	UME1	Q03010	460 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	THI7	Q05998	598 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	SUE1	Q06524	206 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	ECM30	Q06673	1274 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	YLR462W	O13556	202 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	YML002W	P0CF17	737 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	KIN82	P25341	720 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	SWC5	P38326	303 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	YHL049C	P38722	271 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	YEL075C	P39972	122 aa		2.73	□□□□□ -1.97

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