RNA–Protein interactions for RNA: YOR106W

VAM3, Transcript of Syntaxin-like vacuolar t-SNARE, yeast

Gene VAM3, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAM3	YOR106W	NUP145	P49687	1317 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VAM3	YOR106W	FUB1	P25659	250 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VAM3	YOR106W	NTH1	P32356	751 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VAM3	YOR106W	YKU70	P32807	602 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VAM3	YOR106W	SEC6	P32844	805 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VAM3	YOR106W	SET3	P36124	751 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VAM3	YOR106W	GMH1	P36125	273 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VAM3	YOR106W	UBS1	P38290	277 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VAM3	YOR106W	BIT61	P47041	543 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VAM3	YOR106W	PMT3	P47190	753 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VAM3	YOR106W	YGR151C	P53287	111 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VAM3	YOR106W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
VAM3	YOR106W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
VAM3	YOR106W	YML122C	Q03207	126 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VAM3	YOR106W	YDL086W	Q07505	273 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VAM3	YOR106W	RPN13	O13563	156 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VAM3	YOR106W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
VAM3	YOR106W	MPS3	P47069	682 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VAM3	YOR106W	RFX1	P48743	811 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VAM3	YOR106W	COS111	P38308	924 aa		5.84	□□□□□ -1.47
VAM3	YOR106W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
VAM3	YOR106W	UME1	Q03010	460 aa		5.84	□□□□□ -1.47
VAM3	YOR106W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
VAM3	YOR106W	BNR1	P40450	1375 aa		5.83	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	KCC4	P25389	1037 aa		5.83	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	PEX2	P32800	271 aa		5.83	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	CTP1	P38152	299 aa		5.83	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	SPC98	P53540	846 aa		5.83	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	YFT2	Q06676	274 aa		5.83	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	SWI6	P09959	803 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	ADY2	P25613	283 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	EMP70	P32802	667 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	YEL020C	P39994	560 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	KHA1	P40309	873 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	PXA1	P41909	870 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	YPT7	P32939	208 aa		5.81	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	APL3	P38065	1025 aa		5.81	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	PPN1	Q04119	674 aa		5.81	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	YPS7	Q06325	596 aa		5.81	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	ARO10	Q06408	635 aa		5.81	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	NDJ1	Q12366	352 aa		5.81	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	SEC65	P29478	273 aa		5.8	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	MUP3	P38734	546 aa		5.8	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	DUN1	P39009	513 aa		5.8	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	NMA2	P53204	395 aa		5.8	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	YHM2	Q04013	314 aa		5.8	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	HFD1	Q04458	532 aa		5.8	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	YGR237C	P50089	785 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	ECM9	Q02202	377 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	IME1	P21190	360 aa		5.78	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	BUD8	P41698	603 aa		5.78	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	SPO1	P53541	631 aa		5.78	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	RKI1	Q12189	258 aa		5.78	□□□□□ -1.48
VAM3	YOR106W	LAM4	P38800	1345 aa		5.77	□□□□□ -1.49
VAM3	YOR106W	OAF3	P36023	863 aa		5.77	□□□□□ -1.49
VAM3	YOR106W	DID4	P36108	232 aa		5.77	□□□□□ -1.49
VAM3	YOR106W	FLO10	P36170	1169 aa		5.77	□□□□□ -1.49
VAM3	YOR106W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
VAM3	YOR106W	HXT7	P39004	570 aa		5.77	□□□□□ -1.49
VAM3	YOR106W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
VAM3	YOR106W	IMO32	P53219	342 aa		5.77	□□□□□ -1.49
VAM3	YOR106W	DIP5	P53388	608 aa		5.77	□□□□□ -1.49
VAM3	YOR106W	STP4	Q07351	490 aa		5.77	□□□□□ -1.49
VAM3	YOR106W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
VAM3	YOR106W	PMT6	P42934	759 aa		5.76	□□□□□ -1.49
VAM3	YOR106W	TAF4	P50105	388 aa		5.76	□□□□□ -1.49
VAM3	YOR106W	UFO1	Q04511	668 aa		5.76	□□□□□ -1.49
VAM3	YOR106W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
VAM3	YOR106W	STE12	P13574	688 aa		5.75	□□□□□ -1.49
VAM3	YOR106W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
VAM3	YOR106W	ELF1	P36053	145 aa		5.75	□□□□□ -1.49
VAM3	YOR106W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
VAM3	YOR106W	MRK1	P50873	501 aa		5.75	□□□□□ -1.49
VAM3	YOR106W	GPG1	P53130	126 aa		5.75	□□□□□ -1.49
VAM3	YOR106W	IZH3	Q07959	543 aa		5.75	□□□□□ -1.49
VAM3	YOR106W	HFI1	Q12060	488 aa		5.75	□□□□□ -1.49
VAM3	YOR106W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
VAM3	YOR106W	YMC2	P38087	329 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VAM3	YOR106W	PAC2	P39937	518 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VAM3	YOR106W	IES1	P43579	692 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VAM3	YOR106W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
VAM3	YOR106W	NSE5	Q03718	556 aa		5.74	□□□□□ -1.49

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