RNA–Protein interactions for RNA: YMR123W

PKR1, Transcript of V-ATPase assembly factor, yeast

Gene PKR1, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PKR1	YMR123W	KIN82	P25341	720 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PKR1	YMR123W	YKU70	P32807	602 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PKR1	YMR123W	GMH1	P36125	273 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PKR1	YMR123W	CTP1	P38152	299 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PKR1	YMR123W	TDA3	P38758	523 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PKR1	YMR123W	YIL077C	P40508	320 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PKR1	YMR123W	MPS3	P47069	682 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PKR1	YMR123W	BFA1	P47113	574 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PKR1	YMR123W	IMO32	P53219	342 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PKR1	YMR123W	YGR151C	P53287	111 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PKR1	YMR123W	YLR407W	Q06070	228 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PKR1	YMR123W	YFT2	Q06676	274 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PKR1	YMR123W	YDL086W	Q07505	273 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PKR1	YMR123W	ADR1	P07248	1323 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PKR1	YMR123W	IME1	P21190	360 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	SPO11	P23179	398 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	NTH1	P32356	751 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	FLO10	P36170	1169 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	MUP3	P38734	546 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	KHA1	P40309	873 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	HLJ1	P48353	224 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	RFX1	P48743	811 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	YMR210W	Q03649	449 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	THI73	Q07904	523 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	SEC15	P22224	910 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	KCC4	P25389	1037 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	COS111	P38308	924 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	MRK1	P50873	501 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	COQ11	Q05892	277 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	YPS7	Q06325	596 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.38	□□□□□ -1.87	not detected
PKR1	YMR123W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	YMC2	P38087	329 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	PAC2	P39937	518 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	PMT3	P47190	753 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	YGR153W	P48238	217 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	PPN1	Q04119	674 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	RKI1	Q12189	258 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	APM4	Q99186	491 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	PEX2	P32800	271 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	APL3	P38065	1025 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	HXT7	P39004	570 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	MIT1	P40002	666 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	BUD8	P41698	603 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	PXA1	P41909	870 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	YJR142W	P47173	342 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	SPO1	P53541	631 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	SNF12	P53628	566 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	ECM9	Q02202	377 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	UME1	Q03010	460 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	STP4	Q07351	490 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	IZH3	Q07959	543 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	SEC65	P29478	273 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	OAF3	P36023	863 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	IES1	P43579	692 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	NMA2	P53204	395 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	SPC98	P53540	846 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	NSE5	Q03718	556 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	UFO1	Q04511	668 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	HFI1	Q12060	488 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	LAM4	P38800	1345 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	PRE4	P30657	266 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	TAF4	P50105	388 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	GPG1	P53130	126 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	HLR1	Q04429	423 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	NUP145	P49687	1317 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	PHO5	P00635	467 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	DID4	P36108	232 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	DUN1	P39009	513 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	PMT6	P42934	759 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	DIP5	P53388	608 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	DOS2	P54858	310 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PKR1	YMR123W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87

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