RNA–Protein interactions for RNA: YML014W

TRM9, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM9, Length 840 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM9	YML014W	GYL1	Q04322	720 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	AIM39	Q08223	395 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	NUR1	Q12066	484 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	RMP1	Q12530	201 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	KAR3	P17119	729 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	AEP2	P22136	580 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	NFU1	P32860	256 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	YMR187C	Q03236	431 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	VPS54	Q12071	889 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	CIT2	P08679	460 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	SFL1	P20134	766 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	CCL1	P37366	393 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	SWC5	P38326	303 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	APM2	P38700	605 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	PFD1	P46988	109 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	YNL108C	P53929	270 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	TAF9	Q05027	157 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	MDM38	Q08179	573 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	EMP46	Q12396	444 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	ADK2	P26364	225 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	HMT1	P38074	348 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	RGD1	P38339	666 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	MMS21	P38632	267 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	END3	P39013	349 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	GPM2	Q12008	311 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	VPS5	Q92331	675 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TRM9	YML014W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	TKL2	P33315	681 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	JHD1	P40034	492 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	UFO1	Q04511	668 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	TDA9	Q04545	1251 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	YDR278C	Q05612	105 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	SRB2	P34162	210 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	MSC7	P38694	644 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	RAD55	P38953	406 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.26	□□□□□ -0.29	not detected
TRM9	YML014W	YRR1	Q12172	810 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	MET4	P32389	672 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	LTV1	P34078	463 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	PCA1	P38360	1216 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	LYS9	P38999	446 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	ERP2	P39704	215 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	TGL3	P40308	642 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	YIL054W	P40524	105 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	ASG7	P46993	209 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	YML6	P51998	286 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	RIM8	P53179	542 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	YML083C	Q04526	418 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	THI7	Q05998	598 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	TAF1	P46677	1066 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	YNL011C	P53980	444 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	CDC55	Q00362	526 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	FMP25	Q08023	583 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	YBR284W	P38150	797 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	TMA108	P40462	946 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	SAP185	P40856	1058 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	NUT1	P53114	1132 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	YDL073W	Q07454	984 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	THI20	Q08224	551 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	YMR134W	P40207	237 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	KHA1	P40309	873 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	ARG2	P40360	574 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	YFL052W	P43551	465 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	VPS25	P47142	202 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	SLG1	P54867	378 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	ADA2	Q02336	434 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	PRM6	Q04705	352 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	THI21	Q08975	551 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	NBP2	Q12163	236 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRM9	YML014W	YDR018C	Q12185	396 aa		13.21	□□□□□ -0.29

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