RNA–Protein interactions for RNA: YML009C

MRPL39, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit, yeast

Gene MRPL39, Length 213 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPL39	YML009C	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	MSH3	P25336	1018 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	SMC1	P32908	1225 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	HSP78	P33416	811 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	FHL1	P39521	936 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	HOP2	P53187	214 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	TOF2	Q02208	771 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	SEG1	Q04279	960 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	MDM38	Q08179	573 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	TMA16	Q08687	178 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	FMP27	Q06179	2628 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	TOR1	P35169	2470 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	AEP2	P22136	580 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	MRM1	P25270	412 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	GPI10	P30777	616 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	CSE1	P33307	960 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	PSY4	P38193	441 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	UFE1	P41834	346 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	YNR061C	P53747	219 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	TAF9	Q05027	157 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	HRD3	Q05787	833 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	YCG1	Q06680	1035 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	YPR084W	Q06821	456 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	VPS54	Q12071	889 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	SEC65	P29478	273 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	GYP6	P32806	458 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	SGE1	P33335	543 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	ECM13	P38195	257 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	YEL075C	P39972	122 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	PHO86	P46956	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	RSC1	P53236	928 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	MFB1	Q04922	465 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	YLR287C	Q05881	355 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	PMT7	Q06644	662 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	FLC1	Q08967	793 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	SVS1	Q12254	260 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	ARP7	Q12406	477 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL39	YML009C	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	KTR4	P38131	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	YBR053C	P38235	358 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	EXO5	P38289	585 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	HXT8	P40886	569 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	STU2	P46675	888 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	ASG7	P46993	209 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	YJR079W	P47126	109 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	YNR065C	P53751	1116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	YPL062W	Q02781	134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	YML053C	Q04978	212 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	YPR148C	Q06523	435 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	THI20	Q08224	551 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	EMP46	Q12396	444 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	CCP1	P00431	361 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	CAN1	P04817	590 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	KIN3	P22209	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	MSH2	P25847	964 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	MRP4	P32902	394 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	STE5	P32917	917 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	SWE1	P32944	819 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	SRB2	P34162	210 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	SPT23	P35210	1082 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	JNM1	P36224	373 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	MRPL10	P36520	322 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	VFA1	P40080	203 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	PSY2	P40164	858 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	SAP185	P40856	1058 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	NMA2	P53204	395 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	COQ6	P53318	479 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	CAF120	P53836	1060 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	NIS1	P53939	407 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	SSL2	Q00578	843 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	YPL014W	Q02606	381 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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