RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W WSC4P38739 605 aa9.77□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W UFE1P41834 346 aa9.77□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W HRD3Q05787 833 aa9.77□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W RLP24Q07915 199 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W RAD3P06839 778 aa9.76□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W YKL091CP33324 310 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W BAT1P38891 393 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W SBE2P42223 864 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W CPR7P47103 393 aa9.76□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W TDA7P53882 636 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W YPL014WQ02606 381 aa9.76□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W POL2P21951 2222 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W BI4P03879 638 aa9.75□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W CDC11P32458 415 aa9.75□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W STE13P33894 931 aa9.75□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W STS1P38637 319 aa9.75□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W YPS6P40583 537 aa9.75□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W ASG7P46993 209 aa9.75□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W PIR3Q03180 325 aa9.75□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W COX11P19516 300 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W DUG1P43616 481 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W VTC4P47075 721 aa9.74□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W PEX14P53112 341 aa9.74□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W STE20Q03497 939 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W YOL075CQ08234 1294 aa9.74□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W LCB4Q12246 624 aa9.74□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W CAP1P28495 268 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W CCR4P31384 837 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W HSP78P33416 811 aa9.73□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W ECM13P38195 257 aa9.73□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W DUN1P39009 513 aa9.73□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W PSY2P40164 858 aa9.73□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W SPO21Q12411 609 aa9.73□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W ECM3Q99252 613 aa9.73□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W UBP7P40453 1071 aa9.72□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W RSM25P40496 264 aa9.72□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W PFD1P46988 109 aa9.72□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W PEX13P80667 386 aa9.72□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W PPM1Q04081 328 aa9.72□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W RTN1Q04947 295 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
YLR349WYLR349W ARF2P19146 181 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W SGE1P33335 543 aa9.71□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W LEU5P38702 357 aa9.71□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W YJR061WP40355 935 aa9.71□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W MNN10P50108 393 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W LSC2P53312 427 aa9.71□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W FAL1Q12099 399 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W ENO2P00925 437 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W DCW1P36091 449 aa9.7□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W YKL023WP36103 277 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W PYK2P52489 506 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W FLC3P53121 802 aa9.7□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W YNL144CP53907 740 aa9.7□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W TRE1Q08919 783 aa9.7□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W BRR2P32639 2163 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W OM45P16547 393 aa9.69□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W SNF5P18480 905 aa9.69□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W PSO2P30620 661 aa9.69□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W NOP4P37838 685 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W TIF34P40217 347 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W RPT2P40327 437 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W YMR187CQ03236 431 aa9.69□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W RSB1Q08417 382 aa9.69□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W NDD1Q08887 554 aa9.69□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W VPS54Q12071 889 aa9.69□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W NUP84P52891 726 aa9.68□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W AQR1P53943 586 aa9.68□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W YMR206WQ03695 313 aa9.68□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W AI5_BETAQ9ZZX0 354 aa9.68□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W TRA1P38811 3744 aa9.68□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W SAC6P32599 642 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W PFS1P38872 237 aa9.67□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W TRM112P53738 135 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W YPL062WQ02781 134 aa9.67□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W MAK16P10962 306 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W SEC63P14906 663 aa9.66□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W DAL2P25335 343 aa9.66□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W YJU3P28321 313 aa9.66□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W YBR053CP38235 358 aa9.66□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W PRK1P40494 810 aa9.66□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W COQ5P49017 307 aa9.66□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W MND1P53102 219 aa9.66□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data9.66□□□□□ -0.86not detected
YLR349WYLR349W RPN4Q03465 531 aa9.66□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W MDM38Q08179 573 aa9.66□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W SIL1Q08199 421 aa9.66□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W KEX1P09620 729 aa9.65□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W MET22P32179 357 aa9.65□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W RFT1P38206 574 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W SER33P40510 469 aa9.65□□□□□ -0.86
YLR349WYLR349W FIG4P42837 879 aa9.65□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.6 ms