RNA–Protein interactions for RNA: YLR141W

RRN5, Transcript of Protein involved in transcription of rDNA by RNA polymerase I, yeast

Gene RRN5, Length 1,092 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN5	YLR141W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	15.28	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	NSE5	Q03718	556 aa		15.28	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	MDM38	Q08179	573 aa		15.28	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	15.28	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	BI2	P03873	423 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	BI4	P03879	638 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	DSS4	P32601	143 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	YPL062W	Q02781	134 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	BSP1	Q06604	576 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	APC5	Q08683	685 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	15.26	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	15.26	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	COY1	P34237	679 aa		15.26	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	15.26	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	TAF9	Q05027	157 aa		15.26	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	RRN6	P32786	894 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	BCH2	P36122	765 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	YBR053C	P38235	358 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	YDR222W	Q04925	415 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	EMP46	Q12396	444 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	AEP2	P22136	580 aa		15.24	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	DAL1	P32375	460 aa		15.24	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	YKL050C	P35736	922 aa		15.24	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	DUG2	P38149	878 aa		15.24	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	ATG3	P40344	310 aa		15.24	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	HRD3	Q05787	833 aa		15.24	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	OPY2	Q06810	360 aa		15.24	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	APL4	Q12028	832 aa		15.24	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	NUP60	P39705	539 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	STU2	P46675	888 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	ERG5	P54781	538 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	RGR1	P19263	1082 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	STE11	P23561	717 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	PPH22	P23595	377 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	MCM2	P29469	868 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	TDA3	P38758	523 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	VTC4	P47075	721 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	YMR1	P47147	688 aa	Known RBP RIP-Chip data	15.22	■□□□□ 0.03	not detected
RRN5	YLR141W	IRC10	Q08118	586 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	SNZ3	P43545	298 aa		15.21	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	SNZ2	P53824	298 aa		15.21	■□□□□ 0.03
RRN5	YLR141W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	PRK1	P40494	810 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	YGR111W	P53265	400 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	PUT4	P15380	627 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	KAR3	P17119	729 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	SRB2	P34162	210 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	DSF2	P38213	736 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	SSP1	P38871	571 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	AIM39	Q08223	395 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	CLC1	P17891	233 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	YGR021W	P53212	290 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	LCB4	Q12246	624 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	MTF2	P10849	440 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	SGF29	P25554	259 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	SFB2	P53953	876 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	VPS38	Q05919	439 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	HIS5	P07172	385 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	SIR1	P21691	654 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	HSP78	P33416	811 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	GYL1	Q04322	720 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	YCG1	Q06680	1035 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	SIL1	Q08199	421 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	CCP1	P00431	361 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	PCH2	P38126	564 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	HSL7	P38274	827 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	YER189W	P40104	122 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	TUB4	P53378	473 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	FAP1	P53971	965 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	YHM2	Q04013	314 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	ERV41	Q04651	352 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	AIM32	Q04689	311 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	PMT7	Q06644	662 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	THI20	Q08224	551 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	YRR1	Q12172	810 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	ARP7	Q12406	477 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	VPS5	Q92331	675 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RRN5	YLR141W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
RRN5	YLR141W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
RRN5	YLR141W	SPC110	P32380	944 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RRN5	YLR141W	ATG12	P38316	186 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RRN5	YLR141W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01

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