RNA–Protein interactions for RNA: YLR117C

CLF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene CLF1, Length 2,064 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLF1	YLR117C	SRB7	P47822	140 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	FYV6	P53913	173 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	HPC2	Q01448	625 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	ISU1	Q03020	165 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	YDR239C	Q03780	787 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	ENT2	Q05785	613 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	RGA2	Q06407	1009 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	YDR306C	Q06640	478 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	YPT6	Q99260	215 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	RAD61	Q99359	647 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	ATR1	P13090	542 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	STF2	P16965	84 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	CBP3	P21560	335 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	SPC42	P36094	363 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	UIP5	P36137	443 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	SDH8	P38345	138 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	STP2	P38704	541 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	YFH7	P43591	353 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	PGA2	P53903	129 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	SMP3	Q04174	516 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	DXO1	Q06349	442 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	YDL109C	Q12103	647 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	MED4	Q12343	284 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	LDB19	Q12502	818 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	HSF1	P10961	833 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	DAP2	P18962	818 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	RPC53	P25441	422 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	IMP2'	P32351	346 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	EUG1	P32474	517 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	RPC25	P35718	212 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	TY4A-J	P47023	414 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	USE1	P53146	245 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	TOS4	Q06266	489 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	VHS3	Q08438	674 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	YPL277C	Q08989	487 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	BAG7	Q12128	409 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	VCX1	Q99385	411 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	VMA1	P17255	1071 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	MCD4	P36051	919 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	VPS51	P36116	164 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	GLG1	P36143	616 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	VPS29	P38759	282 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	GDH3	P39708	457 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	BOL3	P39724	118 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	YER186C	P40101	306 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	NMD5	P46970	1048 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	ISM1	P48526	1002 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	TAF6	P53040	516 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	RMR1	P53060	241 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	YGL108C	P53139	140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	SNZ1	Q03148	297 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	RAD30	Q04049	632 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	PEX15	Q08215	383 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	SGT1	Q08446	395 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	YOR352W	Q08816	343 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	APM4	Q99186	491 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	FKS3	Q04952	1785 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	CLG1	P35190	452 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	HXT5	P38695	592 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	YTA6	P40328	754 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	ATG32	P40458	529 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	QDR2	P40474	542 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	ZIP2	P53061	704 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	LIF1	P53150	421 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	EEB1	Q02891	456 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	SVF1	Q05515	481 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	VPS36	Q06696	566 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	ADY3	Q07732	790 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	ALE1	Q08548	619 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	VPS54	Q12071	889 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	NTO1	Q12311	748 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	SPS1	P08458	490 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	ERG11	P10614	530 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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