RNA–Protein interactions for RNA: YKL224C

PAU16, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene PAU16, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAU16	YKL224C	VPS54	Q12071	889 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	GPA1	P08539	472 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	HEM14	P40012	539 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	UFE1	P41834	346 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	PFD1	P46988	109 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	COS5	P47187	383 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	COQ6	P53318	479 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	GYL1	Q04322	720 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	YAP7	Q08182	245 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	YRR1	Q12172	810 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	PCT1	P13259	424 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	DAL2	P25335	343 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	HSP78	P33416	811 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	MND1	P53102	219 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	YLR297W	Q05899	129 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	MSF1	P08425	469 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	CSG2	P35206	410 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	SSP1	P38871	571 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	GDH3	P39708	457 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	RSM25	P40496	264 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	VEL1	P53058	206 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	HPF1	Q05164	967 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	ELM1	P32801	640 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	CSE1	P33307	960 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	YMC2	P38087	329 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	BDH2	P39713	417 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	OSW5	P40219	148 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	VTC4	P47075	721 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	HST1	P53685	503 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	ARO80	Q04052	950 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	GUT1	P32190	709 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	MDM38	Q08179	573 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PAU16	YKL224C	APL1	P27351	700 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	SGE1	P33335	543 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	RPC25	P35718	212 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	SAP190	P36123	1033 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	YBR053C	P38235	358 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	PPX1	P38698	397 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	DYS1	P38791	387 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	DUN1	P39009	513 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	PSY2	P40164	858 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	HFM1	P51979	1187 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	YNL144C	P53907	740 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	SPO21	Q12411	609 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	HSF1	P10961	833 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	PRK1	P40494	810 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	SMA1	Q02651	245 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	CSF1	Q12150	2958 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	PIK1	P39104	1066 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	YEL075C	P39972	122 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	EAF1	Q06337	982 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	SPO75	Q07798	868 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	APC5	Q08683	685 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	JIP3	O13555	125 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	KEX1	P09620	729 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	MRC1	P25588	1096 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	STE13	P33894	931 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	UTH1	P36135	365 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	EFM2	P38347	419 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	WSC4	P38739	605 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	UBP7	P40453	1071 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	FLC3	P53121	802 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	RSC1	P53236	928 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	CCP1	P00431	361 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	YER152C	P10356	443 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	MRP4	P32902	394 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	NPY1	P53164	384 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	YMR206W	Q03695	313 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	TAF9	Q05027	157 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	SIL1	Q08199	421 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	NDD1	Q08887	554 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	RML2	P32611	393 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	TFB1	P32776	642 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	SRX1	P36077	127 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	FAA3	P39002	694 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	YAP5	P40574	245 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PAU16	YKL224C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62

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