RNA–Protein interactions for RNA: YKL063C

YKL063C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKL063C, Length 504 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL063C	YKL063C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	ORC2	P32833	620 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	ELF1	P36053	145 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	COS111	P38308	924 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	YJR039W	P47107	1121 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	RIM13	Q03792	727 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	YAP7	Q08182	245 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	NUP1	P20676	1076 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	PRP28	P23394	588 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	CTP1	P38152	299 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	PMT6	P42934	759 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	TFB2	Q02939	513 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	YFT2	Q06676	274 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	VHS3	Q08438	674 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	RKI1	Q12189	258 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	POM34	Q12445	299 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	BIT61	P47041	543 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	SNF12	P53628	566 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	YPS7	Q06325	596 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	ABF1	P14164	731 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	TAX4	P47030	604 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	YLR407W	Q06070	228 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	YKU70	P32807	602 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	YPT7	P32939	208 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	BEM4	P39011	633 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	MRK1	P50873	501 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	YNL193W	P53870	558 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	TRS23	Q03784	219 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	HFD1	Q04458	532 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	GUD1	Q07729	489 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	ICT1	Q12385	394 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	SEC15	P22224	910 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	APL3	P38065	1025 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	XBP1	P40489	647 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	TIM50	Q02776	476 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
YKL063C	YKL063C	IME1	P21190	360 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	TMT1	P32643	299 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	YKR075C	P36155	307 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	MAL31	P38156	614 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	GLO1	P50107	326 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	IZH3	Q07959	543 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	ULA1	Q12059	462 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	TPK2	P06245	380 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	STE4	P18851	423 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	PET127	P32606	800 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	YEL1	P34225	687 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	TMN3	P40071	706 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	BUD8	P41698	603 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	YMR210W	Q03649	449 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	KIN82	P25341	720 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	GAT1	P43574	510 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	PIP2	P52960	996 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	SEG1	Q04279	960 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	UFO1	Q04511	668 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	COG8	Q04632	607 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	ARG7	Q04728	441 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	TUP1	P16649	713 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	AAD3	P25612	363 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	STP4	Q07351	490 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	APN1	P22936	367 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	NTH1	P32356	751 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	TDA3	P38758	523 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	MGS1	P40151	587 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	YJR096W	P47137	282 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	ALG12	P53730	551 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	YTA7	P40340	1379 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	PTP1	P25044	335 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	PPG1	P32838	368 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	HOT13	P36078	116 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	3.66	□□□□□ -1.82	not detected
YKL063C	YKL063C	YGL117W	P53133	265 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	RNH70	P53331	553 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	FRE7	Q12333	620 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL063C	YKL063C	MBR1	P23493	339 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.65	□□□□□ -1.83	not detected
YKL063C	YKL063C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	PPE1	P38796	400 aa		3.65	□□□□□ -1.83

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