RNA–Protein interactions for RNA: YJL197W

UBP12, Transcript of Ubiquitin-specific protease, yeast

Gene UBP12, Length 3,765 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBP12	YJL197W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	PES4	P39684	611 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	OSW2	Q12202	724 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
UBP12	YJL197W	CBP3	P21560	335 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	SGF29	P25554	259 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	ARP4	P80428	489 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	YLR346C	Q06139	101 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	MCH5	Q08777	521 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	BYE1	P36106	594 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	MAD2	P40958	196 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	YFL054C	P43549	646 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	DSE4	P53753	1117 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	MFB1	Q04922	465 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	PGC1	Q08959	321 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	GCN4	P03069	281 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	AAD3	P25612	363 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	POA1	P38218	177 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	IFA38	P38286	347 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	YIL166C	P40445	542 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	BIK1	P11709	440 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	ERG3	P32353	365 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	TED1	P40533	473 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	BSC5	P53755	489 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	CRD1	Q07560	283 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	NBP2	Q12163	236 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	NHA1	Q99271	985 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	YBR138C	P38277	524 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	DJP1	P40564	432 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	POL3	P15436	1097 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	BET2	P20133	325 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	MNT2	P53059	558 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	PUS2	P53167	370 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	NCE103	P53615	221 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	SNO4	Q04902	237 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	AAD4	Q07747	329 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	HSP32	Q08992	237 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	PMS1	P14242	873 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	LRG1	P35688	1017 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	NPR2	P39923	615 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	BRE2	P43132	505 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	HFM1	P51979	1187 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	ALT1	P52893	592 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	TPP1	Q03796	238 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	CNS1	P33313	385 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	RXT2	P38255	430 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	CEP3	P40969	608 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	CIK1	Q01649	594 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	RSB1	Q08417	382 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	DIN7	Q12086	430 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	SKM1	Q12469	655 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	CWH43	P25618	953 aa		4.09	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	PEF1	P53238	335 aa		4.09	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	CUZ1	P53899	274 aa		4.09	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	CTF4	Q01454	927 aa		4.09	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.09	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	APN2	P38207	520 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	GID8	P40208	455 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	EXG2	P52911	562 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	YNR071C	P53757	342 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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