RNA–Protein interactions for RNA: YJL059W

YHC3, Transcript of Protein required for the ATP-dependent transport of arginine, yeast

Gene YHC3, Length 1,227 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHC3	YJL059W	ATP25	Q03153	612 aa		7.32	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	YMR155W	Q03795	547 aa		7.32	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	SWA2	Q06677	668 aa		7.32	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	TOM1	Q03280	3268 aa		7.31	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	MNE1	P24720	663 aa		7.31	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	MLS1	P30952	554 aa		7.31	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	SDS22	P36047	338 aa		7.31	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	FTH1	P38310	465 aa		7.31	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	UME6	P39001	836 aa		7.31	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	KHA1	P40309	873 aa		7.31	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	YJL068C	P40363	299 aa		7.31	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	GYP8	P43570	497 aa		7.31	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	SCW11	P53189	542 aa		7.31	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	CIK1	Q01649	594 aa		7.31	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	YDR514C	Q04408	483 aa		7.31	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	MFB1	Q04922	465 aa		7.31	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	MET7	Q08645	548 aa		7.31	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	REX3	Q12090	404 aa		7.31	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	REC107	P21651	314 aa		7.3	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	NPP1	P25353	742 aa		7.3	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	TRK2	P28584	889 aa		7.3	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	REC104	P33323	182 aa		7.3	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	CAB3	P36076	571 aa		7.3	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	APM3	P38153	483 aa		7.3	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	AXL2	P38928	823 aa		7.3	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	MPH1	P40562	993 aa		7.3	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	MAD3	P47074	515 aa		7.3	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	NIT3	P49954	291 aa		7.3	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	YGR035C	P53222	116 aa		7.3	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	YPL071C	Q02864	156 aa		7.3	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	VID22	Q05934	901 aa		7.3	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	YLH47	Q06493	454 aa		7.3	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	GNT1	Q12096	491 aa		7.3	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	POM152	P39685	1337 aa		7.29	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	MTF2	P10849	440 aa		7.29	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	APN1	P22936	367 aa		7.29	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	PHO3	P24031	467 aa		7.29	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	YCL049C	P25577	312 aa		7.29	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	DLD1	P32891	587 aa		7.29	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	EMC3	P36039	253 aa		7.29	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	HXT7	P39004	570 aa		7.29	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	UBP15	P50101	1230 aa		7.29	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	TAD1	P53065	400 aa		7.29	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	PEX25	Q02969	394 aa		7.29	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	RKM2	Q03942	479 aa		7.29	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	RAD33	Q04231	177 aa		7.29	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	RNH1	Q04740	348 aa		7.29	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	YPR172W	Q06608	200 aa		7.29	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	HFI1	Q12060	488 aa		7.29	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	DCS2	Q12123	353 aa		7.29	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		7.29	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	APM4	Q99186	491 aa		7.29	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	CTT1	P06115	562 aa		7.28	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	PER1	P25625	357 aa		7.28	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	YBR225W	P38321	900 aa		7.28	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	YLF2	P38746	405 aa		7.28	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	TOK1	P40310	691 aa		7.28	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	PSF2	P40359	213 aa		7.28	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	YIL092W	P40497	633 aa		7.28	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	RMD8	P43620	662 aa		7.28	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	POL31	P46957	487 aa		7.28	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	YJR124C	P47159	448 aa		7.28	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	SHE10	P53075	577 aa		7.28	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	ZDS2	P54786	942 aa		7.28	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	RMT2	Q03305	412 aa		7.28	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	GAD1	Q04792	585 aa		7.28	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	APL4	Q12028	832 aa		7.28	□□□□□ -1.24
YHC3	YJL059W	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
YHC3	YJL059W	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		7.27	□□□□□ -1.25
YHC3	YJL059W	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		7.27	□□□□□ -1.25
YHC3	YJL059W	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		7.27	□□□□□ -1.25
YHC3	YJL059W	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		7.27	□□□□□ -1.25
YHC3	YJL059W	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		7.27	□□□□□ -1.25
YHC3	YJL059W	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		7.27	□□□□□ -1.25

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