RNA–Protein interactions for RNA: YHR009C

TDA3, Transcript of Putative oxidoreductase involved in late endosome to Golgi transport, yeast

Gene TDA3, Length 1,572 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TDA3	YHR009C	CDC6	P09119	513 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	YPT7	P32939	208 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	YHR112C	P38716	378 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	TAF4	P50105	388 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	MNT2	P53059	558 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	NSE5	Q03718	556 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	ENT2	Q05785	613 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	MCM21	Q06675	368 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	OPY2	Q06810	360 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	MCH5	Q08777	521 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	VPS5	Q92331	675 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	CBP3	P21560	335 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	EMC1	P25574	760 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	YKR073C	P36153	106 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	TAF5	P38129	798 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	YHR033W	P38690	423 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	ECM1	P39715	212 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	YNL195C	P40168	261 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	PXA1	P41909	870 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	VPS62	P53285	467 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	DUS4	Q06063	367 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	VPS36	Q06696	566 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	SGO1	Q08490	590 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	YOR352W	Q08816	343 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	GPB1	Q08886	897 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	APT2	P36973	181 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	MEF2	P39677	819 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	MNT3	P40549	630 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	YNR071C	P53757	342 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	SNO2	P53823	222 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	PEX19	Q07418	342 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	MED7	Q08278	222 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	NPC2	Q12408	173 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	MTC7	P32633	139 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	RRN3	P36070	627 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	TOS1	P38288	455 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	PUG1	P40100	303 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	SMK1	P41808	388 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	PEF1	P53238	335 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	COX18	P53239	316 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	MEP3	P53390	489 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	PPN1	Q04119	674 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	RER1	P25560	188 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	CHS3	P29465	1165 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	XRS2	P33301	854 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	RPP1	P38786	293 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	PPE1	P38796	400 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	BIT61	P47041	543 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.71	□□□□□ -1.66	not detected
TDA3	YHR009C	MRPL13	Q02204	264 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	YMR018W	Q04364	514 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	TRI1	Q05024	226 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	RXT3	Q07458	294 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	PHO5	P00635	467 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	MTF2	P10849	440 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	YCL049C	P25577	312 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	CWH43	P25618	953 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	PRE4	P30657	266 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	YLF2	P38746	405 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	RAD26	P40352	1085 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	CTH1	P47976	325 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	MDM1	Q01846	1127 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	NRG1	Q03125	231 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	YAP6	Q03935	383 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	TGL5	Q12043	749 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	TRM11	Q12463	433 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	URA3	P03962	267 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	NUC1	P08466	329 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	CTF13	P35203	478 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	TMA108	P40462	946 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	PRM2	P40534	656 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	BNA1	P47096	177 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	MRPS35	P53292	345 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	GCN5	Q03330	439 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TDA3	YHR009C	ATG11	Q12527	1178 aa		4.7	□□□□□ -1.66

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