RNA–Protein interactions for RNA: YHL011C

PRS3, Transcript of 5-phospho-ribosyl-1(alpha)-pyrophosphate synthetase, yeast

Gene PRS3, Length 963 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRS3	YHL011C	STE12	P13574	688 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	CTP1	P38152	299 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	MAL31	P38156	614 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	BIT61	P47041	543 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	YFT2	Q06676	274 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	SEC15	P22224	910 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	VPS34	P22543	875 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	PET127	P32606	800 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	PPG1	P32838	368 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	YKR075C	P36155	307 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	MIT1	P40002	666 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	DIP5	P53388	608 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	ALG12	P53730	551 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	YLR407W	Q06070	228 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	YKU70	P32807	602 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	APL3	P38065	1025 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	MGS1	P40151	587 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	SNM1	P40993	198 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	YMR210W	Q03649	449 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	HOF1	Q05080	669 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	PHO5	P00635	467 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	KIN82	P25341	720 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	SFP1	P32432	683 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	BFA1	P47113	574 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	MRK1	P50873	501 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	DNM1	P54861	757 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	YPS7	Q06325	596 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	OSW1	Q08692	278 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	RKI1	Q12189	258 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRS3	YHL011C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	YMC1	P32331	307 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	ORC2	P32833	620 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	FMP30	Q02883	468 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	AFT2	Q08957	416 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	NTH1	P32356	751 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	ELF1	P36053	145 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	SNF12	P53628	566 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	IZH3	Q07959	543 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	IME1	P21190	360 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	TDA3	P38758	523 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	CKB2	P38930	258 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	BUD8	P41698	603 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	PMT6	P42934	759 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	YJR096W	P47137	282 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	ERG11	P10614	530 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	MNN1	P39106	762 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	PXA1	P41909	870 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	RET2	P43621	546 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	UFO1	Q04511	668 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	ADR1	P07248	1323 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	TMN3	P40071	706 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	RIM13	Q03792	727 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	STP4	Q07351	490 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	TPK2	P06245	380 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	SWI6	P09959	803 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	STE4	P18851	423 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.16	□□□□□ -1.74	not detected
PRS3	YHL011C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	HLJ1	P48353	224 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	ULA1	Q12059	462 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRS3	YHL011C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	TAX4	P47030	604 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	TRS23	Q03784	219 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	HFD1	Q04458	532 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	ARG7	Q04728	441 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	THI73	Q07904	523 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	ICT1	Q12385	394 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	NUP1	P20676	1076 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	SEC65	P29478	273 aa		4.14	□□□□□ -1.75

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