RNA–Protein interactions for RNA: YDL193W

NUS1, Transcript of Putative prenyltransferase, yeast

Gene NUS1, Length 1,128 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NUS1	YDL193W	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	NUP170	P38181	1502 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	RAD26	P40352	1085 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	YIL092W	P40497	633 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	VID28	P40547	921 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	MND2	P40577	368 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	CDA2	Q06703	312 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	NUR1	Q12066	484 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	RER1	P25560	188 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	XRS2	P33301	854 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	TGL1	P34163	548 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	JNM1	P36224	373 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	APT2	P36973	181 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	YHR202W	P38887	602 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	IRC5	P43610	853 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	ORC3	P54790	616 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	ARP4	P80428	489 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	NSE5	Q03718	556 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	PPN1	Q04119	674 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	ENT2	Q05785	613 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	DOP1	Q03921	1698 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	CMP2	P14747	604 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	ATP12	P22135	325 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	SED4	P25365	1065 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	PSY4	P38193	441 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	DUN1	P39009	513 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	ECM1	P39715	212 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	GID8	P40208	455 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	TMA108	P40462	946 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	IES1	P43579	692 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	EXG2	P52911	562 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	REC102	Q02721	264 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	TRI1	Q05024	226 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	OMS1	Q06668	471 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	SSP2	Q08646	371 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	YOR352W	Q08816	343 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
NUS1	YDL193W	TY2B-B	Q12491	1770 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	CHS3	P29465	1165 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	PET127	P32606	800 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	YBR259W	P38338	688 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	YLF2	P38746	405 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	SAK1	P38990	1142 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	HIM1	Q06674	414 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	MCM21	Q06675	368 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	SWM1	Q12379	170 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	VPS5	Q92331	675 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	MMS22	Q06164	1454 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	CDC26	P14724	124 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	HXT4	P32467	576 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	APM3	P38153	483 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	YEL076C	P39971	216 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	MET12	P46151	657 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	SRB7	P47822	140 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	ASI2	P53895	289 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	GTR1	Q00582	310 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	PKH1	Q03407	766 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	ADY3	Q07732	790 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	TPO1	Q07824	586 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	ESC8	Q08119	714 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	UPC2	Q12151	913 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NUS1	YDL193W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	IMP2'	P32351	346 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	TOA1	P32773	286 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	RRN3	P36070	627 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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