RNA–Protein interactions for RNA: YBR273C

UBX7, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene UBX7, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX7	YBR273C	RTT102	P53330	157 aa		5.09	□□□□□ -1.59
UBX7	YBR273C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
UBX7	YBR273C	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
UBX7	YBR273C	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
UBX7	YBR273C	HFD1	Q04458	532 aa		5.09	□□□□□ -1.59
UBX7	YBR273C	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
UBX7	YBR273C	YDR018C	Q12185	396 aa		5.09	□□□□□ -1.59
UBX7	YBR273C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	IME1	P21190	360 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	GPI10	P30777	616 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	SIN4	P32259	974 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	TVP38	P36164	337 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	STV1	P37296	890 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	DUG2	P38149	878 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	RFC3	P38629	340 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	APM2	P38700	605 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	MSR1	P38714	643 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	ERC1	P38767	581 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	YJR142W	P47173	342 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	PUS2	P53167	370 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	ERP6	P53198	216 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	YAF9	P53930	226 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	TBF1	Q02457	562 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	ATG20	Q07528	640 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	IES4	Q08561	116 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	OSW1	Q08692	278 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	CIR2	Q08822	631 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	TFB4	Q12004	338 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	YRR1	Q12172	810 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	RRD2	Q12461	358 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	BI2	P03873	423 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	BI4	P03879	638 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	CBP1	P07252	654 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	REC107	P21651	314 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	SCJ1	P25303	377 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	MGT1	P26188	188 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	DPH2	P32461	534 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	CBF2	P32504	956 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	OCT1	P35999	772 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	VAB2	P40003	282 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	TMN3	P40071	706 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	ALG5	P40350	334 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.07	□□□□□ -1.6	not detected
UBX7	YBR273C	PEX21	P50091	288 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	RTA1	P53047	317 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	CUL3	P53202	744 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	YGR117C	P53270	476 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	YNL108C	P53929	270 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	SLT2	Q00772	484 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	UBP2	Q01476	1272 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	SPO19	Q03029	223 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	HOT1	Q03213	719 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	ADI1	Q03677	179 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	COQ9	Q05779	260 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	THI7	Q05998	598 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	DUS4	Q06063	367 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	UBX5	Q06682	500 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	TRE1	Q08919	783 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	GPM3	Q12326	303 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	CSR2	Q12734	1121 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	RAD10	P06838	210 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	EXO70	P19658	623 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	HEM3	P28789	327 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	TMT1	P32643	299 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	YME2	P32843	850 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	YMC2	P38087	329 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	SMF2	P38778	549 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	ERP5	P38819	212 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	GPB2	P39717	880 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	YEL025C	P39991	1188 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	JEM1	P40358	645 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	HOS4	P40480	1083 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	PRK1	P40494	810 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	SNZ3	P43545	298 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	AVT1	P47082	602 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	UBP15	P50101	1230 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	PCL10	P53124	433 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX7	YBR273C	RCF2	P53721	224 aa		5.06	□□□□□ -1.6

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