RNA–Protein interactions for RNA: YAL017W

PSK1, Transcript of PAS domain-containing serine/threonine protein kinase, yeast

Gene PSK1, Length 4,071 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSK1	YAL017W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	CLB4	P24871	460 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	MGM1	P32266	881 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	PHO3	P24031	467 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	DID4	P36108	232 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	ATF1	P40353	525 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	SIW14	P53965	281 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	ISU1	Q03020	165 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	ECM7	Q06200	448 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	YLH47	Q06493	454 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	PSY3	Q12318	242 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	STE12	P13574	688 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	KAR3	P17119	729 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	SEC65	P29478	273 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	KRE6	P32486	720 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	YUH1	P35127	236 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	YHR131C	P38835	850 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	CAF16	P43569	289 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	TCB2	P48231	1178 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	TOF2	Q02208	771 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	FDC1	Q03034	503 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	HLR1	Q04429	423 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	MET7	Q08645	548 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	CIR2	Q08822	631 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	GPM3	Q12326	303 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	YCL049C	P25577	312 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	PEP3	P27801	918 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	HOG1	P32485	435 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	SRO77	P38163	1010 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	AIM46	P38885	310 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	LAM5	P43560	674 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	TOF1	P53840	1238 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	FMP45	Q07651	309 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	GAL7	P08431	366 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	PRB1	P09232	635 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	PUT4	P15380	627 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	AMS1	P22855	1083 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	RSC6	P25632	483 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	MRP4	P32902	394 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	EMP65	P40085	556 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	SPO22	P40511	975 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	YNL050C	P53952	270 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	ERV1	P27882	189 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	GYP6	P32806	458 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	SUR1	P33300	382 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	DYS1	P38791	387 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	RKM4	Q12504	494 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	SPS22	P25380	463 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	ADK2	P26364	225 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	MRE11	P32829	692 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	BUD2	P33314	1104 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	YBR138C	P38277	524 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	MTG2	P38860	518 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	HFM1	P51979	1187 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	CUL3	P53202	744 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	YPQ2	Q06328	317 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	WTM2	Q12206	467 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	DNA2	P38859	1522 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
PSK1	YAL017W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
PSK1	YAL017W	PCH2	P38126	564 aa		3.09	□□□□□ -1.92
PSK1	YAL017W	DOT5	P40553	215 aa		3.09	□□□□□ -1.92
PSK1	YAL017W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	3.09	□□□□□ -1.92	not detected
PSK1	YAL017W	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.92
PSK1	YAL017W	NGL3	Q03210	505 aa		3.09	□□□□□ -1.92
PSK1	YAL017W	EST2	Q06163	884 aa		3.09	□□□□□ -1.92
PSK1	YAL017W	RRT8	Q08219	342 aa		3.09	□□□□□ -1.92
PSK1	YAL017W	GIS3	Q12418	502 aa		3.09	□□□□□ -1.92
PSK1	YAL017W	SEM1	O94742	89 aa		3.09	□□□□□ -1.92
PSK1	YAL017W	POL3	P15436	1097 aa		3.09	□□□□□ -1.92
PSK1	YAL017W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
PSK1	YAL017W	DOA4	P32571	926 aa		3.09	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 123.7 ms