RNA–Protein interactions for RNA: YMR270C

RRN9, Transcript of Protein involved in promoting high level transcription of rDNA, yeast

Gene RRN9, Length 1,098 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN9	YMR270C	FUI1	P38196	639 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	POA1	P38218	177 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	JHD1	P40034	492 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	ROD1	Q02805	837 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	EST2	Q06163	884 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	RKM4	Q12504	494 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	TAF13	P11747	167 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	PEP3	P27801	918 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	BUD2	P33314	1104 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	RIM11	P38615	370 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	GDH3	P39708	457 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	GEM1	P39722	662 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	UBP5	P39944	805 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	PMT3	P47190	753 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	MAL11	P53048	616 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	MDR1	P53258	950 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	MSC2	Q03455	724 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	YMR321C	Q04898	105 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	TFC6	Q06339	672 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	DSE3	Q08729	430 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	SLX4	Q12098	748 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	MAS2	P11914	482 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	NPR1	P22211	790 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	CDC11	P32458	415 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	LRG1	P35688	1017 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	MBP1	P39678	833 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	SPO22	P40511	975 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	AZR1	P50080	613 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	SDH1	Q00711	640 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	THI73	Q07904	523 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	YOR223W	Q12015	292 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRN9	YMR270C	TAO3	P40468	2376 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	SWI6	P09959	803 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	MEF1	P25039	761 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	RNQ1	P25367	405 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	FUB1	P25659	250 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
RRN9	YMR270C	IMP2'	P32351	346 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	SEG2	P34250	1132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	TVP38	P36164	337 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	DAS1	P47005	663 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
RRN9	YMR270C	UME1	Q03010	460 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	SKY1	Q03656	742 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	SND1	Q04007	877 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	ATG11	Q12527	1178 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
RRN9	YMR270C	HIP1	P06775	603 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	POL3	P15436	1097 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	SAS3	P34218	831 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	RDH54	P38086	958 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	FLR1	P38124	548 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	OPY1	P38271	328 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	CCC2	P38995	1004 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	YGL176C	P46945	554 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	ENT3	P47160	408 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	SGM1	P47166	707 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	ECL1	P48235	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	SCS3	P53012	380 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	GPG1	P53130	126 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	PHM6	Q05637	104 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	SUE1	Q06524	206 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	TOP3	P13099	656 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	MKK2	P32491	506 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
RRN9	YMR270C	YKL107W	P34251	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	SHU2	P38957	223 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	DSS1	P39112	969 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	CSM2	P40465	213 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	MMM1	P41800	426 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62

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