RNA–Protein interactions for RNA: YLR285W

NNT1, Transcript of S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase, yeast

Gene NNT1, Length 786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NNT1	YLR285W	NIC96	P34077	839 aa		4	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	MNN4	P36044	1178 aa		4	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	MAL31	P38156	614 aa		4	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	YJR039W	P47107	1121 aa		4	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	STB4	P50104	949 aa		4	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	UBX4	P54730	416 aa		4	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	YHM2	Q04013	314 aa		4	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	IRC10	Q08118	586 aa		4	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	GAL1	P04385	528 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	IES5	P40060	125 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	SDP1	P40479	209 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	SLD3	P53135	668 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	SPC105	P53148	917 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	ARP4	P80428	489 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	ATG16	Q03818	150 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	PEX15	Q08215	383 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	YPR027C	Q12079	277 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	ACF2	Q12168	779 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	NPC2	Q12408	173 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	SWI6	P09959	803 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	PTP2	P29461	750 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	SEC65	P29478	273 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	FAT1	P38225	669 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	YHR078W	P38799	552 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	BEM4	P39011	633 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	SSY5	P47002	699 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	MLC2	Q06580	163 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	KCC4	P25389	1037 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	DPB3	P27344	201 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	STE14	P32584	239 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	YKL133C	P36066	463 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	KTR4	P38131	464 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	YGR021W	P53212	290 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	VPS72	Q03388	795 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	YMR206W	Q03695	313 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	UPC2	Q12151	913 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	GPR1	Q12361	961 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NNT1	YLR285W	YKU70	P32807	602 aa		3.96	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	RIM4	P38741	713 aa		3.96	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	BFA1	P47113	574 aa		3.96	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	NDJ1	Q12366	352 aa		3.96	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.96	□□□□□ -1.78	not detected
NNT1	YLR285W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	YKR075C	P36155	307 aa		3.95	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	SAK1	P38990	1142 aa		3.95	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.95	□□□□□ -1.78	not detected
NNT1	YLR285W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	ASI2	P53895	289 aa		3.95	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	ASM4	Q05166	528 aa		3.95	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	LAS17	Q12446	633 aa		3.95	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	ATP12	P22135	325 aa		3.94	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	SED4	P25365	1065 aa		3.94	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	PZF1	P39933	429 aa		3.94	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	GID8	P40208	455 aa		3.94	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	PFA3	P42836	336 aa		3.94	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	3.94	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	ORC4	P54791	529 aa		3.94	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	3.94	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	CDC26	P14724	124 aa		3.93	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	ERG4	P25340	473 aa		3.93	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	KAR4	P25583	335 aa		3.93	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	PTH2	P34222	208 aa		3.93	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	MTH1	P35198	433 aa		3.93	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	APN2	P38207	520 aa		3.93	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	YHL041W	P38730	149 aa		3.93	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	YHR202W	P38887	602 aa		3.93	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	VID28	P40547	921 aa		3.93	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	IES1	P43579	692 aa		3.93	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	BUL1	P48524	976 aa		3.93	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	3.93	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	NCS6	P53088	359 aa		3.93	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	HOL1	P53389	586 aa		3.93	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	YLR407W	Q06070	228 aa		3.93	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	YDL121C	Q07541	149 aa		3.93	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	YLR415C	O13578	112 aa		3.92	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
NNT1	YLR285W	MSS18	P08593	268 aa		3.92	□□□□□ -1.78

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