RNA–Protein interactions for RNA: YLR078C

BOS1, Transcript of v-SNARE (vesicle specific SNAP receptor), yeast

Gene BOS1, Length 735 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BOS1	YLR078C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	MTL1	P53214	551 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	PPS1	P38148	807 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	BCD1	P38772	366 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	UBC11	P52492	156 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	COX18	P53239	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	CTF4	Q01454	927 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	ECM9	Q02202	377 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	DID4	P36108	232 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	LYS9	P38999	446 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	DAS1	P47005	663 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	REV7	P38927	245 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	HXT7	P39004	570 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	NUP60	P39705	539 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	FMP52	P40008	231 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	SLI1	P53304	468 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	YMR210W	Q03649	449 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	YLR407W	Q06070	228 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	OMS1	Q06668	471 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	VHS3	Q08438	674 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	SGO1	Q08490	590 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	SWI6	P09959	803 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	PEX1	P24004	1043 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	SEC65	P29478	273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	HIR1	P32479	840 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	PET127	P32606	800 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	FMO1	P38866	432 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	GET2	P40056	285 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	YNL195C	P40168	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	YMR206W	Q03695	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	YHM2	Q04013	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	HFI1	Q12060	488 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	ACF2	Q12168	779 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	YKU70	P32807	602 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	YHL017W	P38745	532 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	RIA1	P53893	1110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	APM4	Q99186	491 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	ECM3	Q99252	613 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BOS1	YLR078C	SIR3	P06701	978 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	OAR1	P35731	278 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	OAF3	P36023	863 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	STB4	P50104	949 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	TEL2	P53038	688 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	YAP1802	P53309	568 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	TIM44	Q01852	431 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	MUK1	Q02866	612 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	VPS36	Q06696	566 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	EUG1	P32474	517 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	MOH1	P38191	138 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	SFB3	P38810	929 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	YPS7	Q06325	596 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	THI22	Q06490	572 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	TMA17	Q12513	150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	YPT7	P32939	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	FAT1	P38225	669 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	PCL5	P38794	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	BIT61	P47041	543 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	SSL2	Q00578	843 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	TRE2	Q08693	809 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	MCH5	Q08777	521 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	ZRT2	Q12436	422 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	POM34	Q12445	299 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	SEC15	P22224	910 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	PAF1	P38351	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
BOS1	YLR078C	RMP1	Q12530	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	KIN82	P25341	720 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.3 ms